More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2977 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
523 aa  1012    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.467356  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
511 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
525 aa  223  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.4344  normal  0.880748 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
514 aa  199  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701214  normal  0.0728471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5688  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
284 aa  169  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748678  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
273 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
288 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.706762  hitchhiker  0.0028911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
286 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  normal  0.263376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
254 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
268 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
286 aa  110  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720808  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
280 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
260 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
278 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.18 
 
 
261 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
266 aa  106  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
250 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
250 aa  100  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0247808  normal  0.0244453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
258 aa  97.8  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.83 
 
 
249 aa  97.4  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
279 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6164  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  35.48 
 
 
282 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 
256 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 
256 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783663  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
246 aa  95.1  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
282 aa  94.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  32.4 
 
 
249 aa  94  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
243 aa  94  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
282 aa  94  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0528385  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
288 aa  94  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  28.76 
 
 
250 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
268 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  28.32 
 
 
251 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  27.55 
 
 
279 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  27.07 
 
 
251 aa  92.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  28.32 
 
 
251 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  28.32 
 
 
250 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
257 aa  91.3  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
271 aa  90.9  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.9 
 
 
286 aa  90.9  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  30.73 
 
 
265 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 
251 aa  90.5  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3460  ABC transporter membrane spanning protein  29.86 
 
 
288 aa  90.1  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  27.43 
 
 
250 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  27.43 
 
 
250 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  29.31 
 
 
266 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  27.43 
 
 
250 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  27.43 
 
 
250 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.76 
 
 
263 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
274 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
275 aa  89.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.33 
 
 
375 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  30.21 
 
 
257 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  30.21 
 
 
265 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  30.21 
 
 
265 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
255 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  27.43 
 
 
250 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.18 
 
 
281 aa  88.6  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  30.21 
 
 
257 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 
265 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  30.21 
 
 
255 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  30.21 
 
 
257 aa  87.8  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  30.21 
 
 
257 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  30.21 
 
 
257 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
306 aa  87.8  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 
272 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.33 
 
 
375 aa  87  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.149558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
255 aa  87  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
272 aa  87  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
307 aa  87  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.665089  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
289 aa  87  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  28.11 
 
 
265 aa  87  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
256 aa  86.7  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.73 
 
 
272 aa  86.7  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
254 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  34.9 
 
 
279 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  28.76 
 
 
266 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58323  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 
259 aa  84  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.73 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.674946  normal  0.833857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.725502  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
257 aa  83.2  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.14 
 
 
258 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
282 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  30.96 
 
 
247 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  32.65 
 
 
488 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  35.52 
 
 
279 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
292 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
256 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.22 
 
 
286 aa  82.4  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113814  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.167871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.05 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443029  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.47 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>