More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_41294 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_41294  predicted protein  100 
 
 
762 aa  1565    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  35.71 
 
 
495 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.2 
 
 
571 aa  191  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  34.2 
 
 
579 aa  184  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  34.27 
 
 
629 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2510  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.6 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  34.27 
 
 
629 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.04 
 
 
599 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.04 
 
 
581 aa  180  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.67 
 
 
626 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.65 
 
 
418 aa  179  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.69 
 
 
630 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.65 
 
 
418 aa  179  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.67 
 
 
626 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.67 
 
 
627 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  35.82 
 
 
506 aa  177  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.88 
 
 
578 aa  177  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.88 
 
 
577 aa  177  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.41 
 
 
549 aa  177  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  34.55 
 
 
622 aa  177  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.81 
 
 
452 aa  177  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.97 
 
 
443 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.82 
 
 
598 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1331  ATP-dependent RNA helicase RhlE  32.98 
 
 
456 aa  176  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35 
 
 
477 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  32.81 
 
 
574 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.48 
 
 
452 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.52 
 
 
540 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.24 
 
 
441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3682  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.47 
 
 
601 aa  174  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.54 
 
 
578 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0856  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.71 
 
 
503 aa  174  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0104833  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2088  putative ATP-dependent RNA helicase 1  32.79 
 
 
453 aa  173  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.936977 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.09 
 
 
515 aa  173  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.09 
 
 
515 aa  173  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2810  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.71 
 
 
451 aa  173  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.63 
 
 
522 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2898  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.71 
 
 
451 aa  173  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.82 
 
 
463 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  32.86 
 
 
557 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.15 
 
 
545 aa  172  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34 
 
 
550 aa  172  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  34.03 
 
 
527 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.32 
 
 
549 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.71 
 
 
476 aa  172  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.61 
 
 
493 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.89 
 
 
535 aa  171  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  33.14 
 
 
445 aa  171  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.11 
 
 
453 aa  171  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.13 
 
 
466 aa  170  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  34.13 
 
 
425 aa  170  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.11 
 
 
453 aa  170  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.11 
 
 
453 aa  170  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.11 
 
 
453 aa  170  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.11 
 
 
453 aa  170  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.71 
 
 
628 aa  170  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34 
 
 
471 aa  170  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2211  ATP-dependent RNA helicase protein  32.51 
 
 
495 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.43 
 
 
525 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.43 
 
 
525 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.39 
 
 
438 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.78 
 
 
493 aa  170  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.43 
 
 
515 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.62 
 
 
533 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.43 
 
 
526 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1011  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.96 
 
 
453 aa  169  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0528  putative ATP-dependent RNA helicase  32.86 
 
 
635 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.358611  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.42 
 
 
487 aa  169  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.79 
 
 
479 aa  169  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05560  ATP-dependent RNA helicase  32.86 
 
 
639 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978664  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  32.51 
 
 
462 aa  168  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03147  ATP-dependent RNA helicase  33.63 
 
 
460 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457785  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.73 
 
 
565 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  33.43 
 
 
429 aa  168  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.55 
 
 
415 aa  168  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3519  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.56 
 
 
436 aa  167  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.71 
 
 
555 aa  167  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.131298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.81 
 
 
484 aa  167  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.59 
 
 
491 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.15 
 
 
454 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  33.53 
 
 
477 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.15 
 
 
454 aa  167  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.75 
 
 
477 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  31.15 
 
 
454 aa  167  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.15 
 
 
454 aa  167  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.15 
 
 
454 aa  167  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  31.15 
 
 
454 aa  167  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.15 
 
 
455 aa  167  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0791  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.4 
 
 
624 aa  167  9e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000437602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.51 
 
 
471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000222801  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  32.19 
 
 
510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  32.55 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.15 
 
 
454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3310  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  34.02 
 
 
507 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.95 
 
 
482 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  34.16 
 
 
492 aa  166  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  34.02 
 
 
543 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.75 
 
 
522 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  33.72 
 
 
506 aa  165  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.01 
 
 
515 aa  165  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>