40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27583 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  100 
 
 		 476 aa  969    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  70.35 
 
 		 559 aa  693    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  58.53 
 
 		 478 aa  592  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  60 
 
 		 478 aa  588  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  54.62 
 
 		 478 aa  540  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  37.47 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  35.06 
 
 		 442 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  35.55 
 
 		 443 aa  262  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  35.5 
 
 		 476 aa  261  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  34.63 
 
 		 442 aa  253  7e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  36.13 
 
 		 443 aa  252  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  34.63 
 
 		 442 aa  249  7e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  31.97 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  32.38 
 
 		 492 aa  223  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  30.08 
 
 		 501 aa  223  7e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  32.03 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  31.26 
 
 		 599 aa  221  3e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  31.96 
 
 		 477 aa  219  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  31.84 
 
 		 479 aa  216  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  30.2 
 
 		 479 aa  211  3e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  31.22 
 
 		 492 aa  211  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  32.19 
 
 		 500 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  31.69 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  31.02 
 
 		 489 aa  204  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  30.59 
 
 		 463 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  30.83 
 
 		 492 aa  187  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  30.36 
 
 		 504 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  29.14 
 
 		 459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  28.96 
 
 		 460 aa  176  6e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  30.27 
 
 		 482 aa  176  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  29.25 
 
 		 537 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  29.05 
 
 		 465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  29.84 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  28.66 
 
 		 455 aa  161  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  26.46 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  26.26 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  28.96 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1887  preprotein translocase subunit SecY  26.56 
 
 		 431 aa  44.3  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.729916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  25.14 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0078  preprotein translocase subunit SecY  26.04 
 
 		 434 aa  43.5  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0917629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>