46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1697 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  100 
 
 		 605 aa  1248    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  41.82 
 
 		 602 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  59.56 
 
 		 483 aa  267  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  54.42 
 
 		 456 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  48.25 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  50.88 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  44.59 
 
 		 479 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  36.1 
 
 		 436 aa  123  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5557  hypothetical protein  23.28 
 
 		 568 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.740947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  38.61 
 
 		 435 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  37.25 
 
 		 435 aa  90.5  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  33.01 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  38.79 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  31.15 
 
 		 518 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  28.19 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  30.29 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0183  Flp pilus assembly protein TadG  33.15 
 
 		 562 aa  72.8  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.44527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  32.12 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  66 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  27.1 
 
 		 666 aa  65.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  35.06 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  30.41 
 
 		 449 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 511 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  24.33 
 
 		 500 aa  62  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3028  hypothetical protein  27.91 
 
 		 605 aa  62  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  24.56 
 
 		 568 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  28.71 
 
 		 566 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  25.79 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  28.71 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  25 
 
 		 461 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  30.07 
 
 		 437 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3441  hypothetical protein  25.25 
 
 		 612 aa  52  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00864363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  27.61 
 
 		 462 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  27.56 
 
 		 409 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2151  hypothetical protein  25.44 
 
 		 582 aa  50.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.940031  normal  0.0926842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  28 
 
 		 553 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0295  hypothetical protein  24.41 
 
 		 528 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  29.57 
 
 		 126 aa  47.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3511  hypothetical protein  38.1 
 
 		 473 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  34.13 
 
 		 432 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3818  hypothetical protein  38.1 
 
 		 473 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2645  hypothetical protein  25.68 
 
 		 319 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5624  hypothetical protein  40.43 
 
 		 359 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.542245  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  29.19 
 
 		 477 aa  44.3  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  27.36 
 
 		 423 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  27.36 
 
 		 423 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>