More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2170 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 
324 aa  663    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  51.54 
 
 
311 aa  328  6e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  42.34 
 
 
328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  42.55 
 
 
329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  40.91 
 
 
330 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  40.61 
 
 
330 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  38.97 
 
 
328 aa  225  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  39.7 
 
 
330 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  32.61 
 
 
357 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  34.96 
 
 
351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  28.21 
 
 
389 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  27.69 
 
 
389 aa  149  9e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  29.24 
 
 
380 aa  138  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  28.53 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  27.1 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  29.54 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  28.61 
 
 
387 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  27.27 
 
 
370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  37.37 
 
 
387 aa  126  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  28.21 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  27.68 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  26.97 
 
 
370 aa  112  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  28.39 
 
 
371 aa  106  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  44.66 
 
 
346 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  25 
 
 
369 aa  97.1  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  30.14 
 
 
363 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  29.82 
 
 
371 aa  87  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  36.43 
 
 
369 aa  85.9  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.79 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  38.64 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  32.57 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  34.88 
 
 
369 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  34.88 
 
 
369 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  29.53 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.45 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  30.29 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  26.17 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  28.08 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  29.44 
 
 
529 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  31.06 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  24.93 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  30.3 
 
 
529 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  25.52 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  27.67 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  27.4 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.73 
 
 
425 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  26.71 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  35.62 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0810  GTPase ObgE  28.57 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0769748  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  28.83 
 
 
485 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  28.83 
 
 
485 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  28.83 
 
 
485 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.23 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  32.61 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.95 
 
 
463 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  31.36 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  26.53 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.82 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  29.38 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  29.45 
 
 
424 aa  69.3  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  26.61 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  27.01 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  31.09 
 
 
560 aa  67.8  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  30 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  29.73 
 
 
516 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  29.38 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.22 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.26 
 
 
464 aa  67  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  29.15 
 
 
500 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.05 
 
 
517 aa  66.6  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.77 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  28.4 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  28.65 
 
 
435 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  28.48 
 
 
515 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  29.32 
 
 
329 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.7 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  30.37 
 
 
435 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1157  GTP-binding proten HflX  29.84 
 
 
417 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.13 
 
 
505 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  24.67 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  27.78 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  32.52 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.22 
 
 
417 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf270  GTPase ObgE  30.06 
 
 
422 aa  63.9  0.000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.320591  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.37 
 
 
503 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  32.82 
 
 
400 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.29 
 
 
450 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  27.98 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  27.27 
 
 
335 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  25.99 
 
 
427 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.47 
 
 
458 aa  63.5  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.17 
 
 
425 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  28.72 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  28.65 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  31.11 
 
 
433 aa  63.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.88 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  28.4 
 
 
337 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1065  GTP-binding proten HflX  29.27 
 
 
417 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0524  GTP-binding protein, HSR1-like  27.27 
 
 
433 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227372  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  26.9 
 
 
513 aa  63.5  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>