51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4285 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4285  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.108694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2153  membrane protein-like protein  35.15 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0475  hypothetical protein  38.31 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0407  hypothetical protein  36.69 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3838  protein of unknown function DUF1275  31.13 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.036999  normal  0.190043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4207  protein of unknown function DUF1275  36.9 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249514  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2773  protein of unknown function DUF1275  38.41 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4228  hypothetical protein  31.95 
 
 		 207 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0804  hypothetical protein  34.2 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1053  protein of unknown function DUF1275  30.14 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1320  hypothetical protein  33.56 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0118  hypothetical protein  35.26 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0128  hypothetical protein  35.26 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0137  hypothetical protein  35.26 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  31.11 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  30.73 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1998  protein of unknown function DUF1275  34.54 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  33.77 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  32.37 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  32.37 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  30.36 
 
 		 238 aa  49.7  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1257  hypothetical protein  26.37 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1310  hypothetical protein  32.72 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.109342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  29.8 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  35.29 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0326  protein of unknown function DUF1275  30.26 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  43.3 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  32.65 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4542  hypothetical protein  33.54 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  31.46 
 
 		 224 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  45.31 
 
 		 209 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  43.82 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  50.77 
 
 		 233 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  43.42 
 
 		 228 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1276  hypothetical protein  31.25 
 
 		 231 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1399  hypothetical protein  32.28 
 
 		 232 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  26.06 
 
 		 241 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0917  hypothetical protein  32.28 
 
 		 232 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1377  hypothetical protein  32.28 
 
 		 232 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.343918  normal  0.236805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  30.94 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2954  hypothetical protein  30.82 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.626632  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  33.67 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4752  hypothetical protein  27.17 
 
 		 244 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1238  hypothetical protein  29.61 
 
 		 203 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0277  hypothetical protein  23.45 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000465928  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  27.71 
 
 		 658 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0144  protein of unknown function DUF1275  39.39 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  40.62 
 
 		 233 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4098  hypothetical protein  35 
 
 		 236 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0190  hypothetical protein  30.26 
 
 		 196 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0735535 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  28.51 
 
 		 236 aa  42.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>