More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2559 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  100 
 
 		 309 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  73.9 
 
 		 300 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  73.09 
 
 		 302 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  71.97 
 
 		 305 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  67.11 
 
 		 309 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  70.24 
 
 		 298 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  69.52 
 
 		 307 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  68.12 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  69.76 
 
 		 302 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  70.14 
 
 		 308 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  70.03 
 
 		 316 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  70.14 
 
 		 308 aa  391  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  66.78 
 
 		 312 aa  385  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  64.86 
 
 		 311 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  64.9 
 
 		 309 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  69.79 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  65.12 
 
 		 308 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  65.79 
 
 		 312 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  64.77 
 
 		 340 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  65.42 
 
 		 297 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  66.67 
 
 		 302 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  66.78 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  67.12 
 
 		 305 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  63.51 
 
 		 306 aa  364  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  62.71 
 
 		 306 aa  362  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  63.36 
 
 		 299 aa  359  4e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  59.68 
 
 		 328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.08 
 
 		 337 aa  352  4e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  60 
 
 		 317 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  56.79 
 
 		 298 aa  348  9e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  54.61 
 
 		 302 aa  347  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  60.07 
 
 		 313 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  60.07 
 
 		 313 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  60.07 
 
 		 313 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  60.07 
 
 		 300 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  59.39 
 
 		 301 aa  333  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.54 
 
 		 317 aa  325  6e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  61.36 
 
 		 300 aa  321  8e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.96 
 
 		 324 aa  315  6e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50 
 
 		 302 aa  299  5e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  63.76 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  50.69 
 
 		 307 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  50.69 
 
 		 307 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  50.34 
 
 		 307 aa  255  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  51.57 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  41.64 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  39.8 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  43.42 
 
 		 390 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  43.05 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  41.55 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  41.64 
 
 		 303 aa  205  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 		 297 aa  202  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  34.25 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  35.33 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  35.33 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  36.68 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  37.41 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  36.68 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  34.01 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.29 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  35.62 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  35.64 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.29 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  38.44 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 305 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  32.65 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  33.33 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  34.01 
 
 		 293 aa  182  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  34.33 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  42 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.5 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  27.74 
 
 		 290 aa  178  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  35.62 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  39.55 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  43.15 
 
 		 249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  39.6 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  36.77 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  36.79 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  30.85 
 
 		 286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  36.86 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  37.71 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  38.14 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  46.12 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  40.84 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  35.92 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  35.92 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  39.48 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  36.65 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  39.8 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  35.5 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  38.34 
 
 		 331 aa  165  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  34.53 
 
 		 319 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  32.07 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  35.5 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>