103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2411 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  100 
 
 		 242 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  38.17 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  38.24 
 
 		 217 aa  89  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  41.09 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  40.29 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  37.97 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  39.63 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  39.72 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  37.28 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  35.75 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  36.13 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  39.01 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  47.06 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  40 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  36.44 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  47.83 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  33.09 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  42.36 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3325  prepilin peptidase  30.54 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  39.16 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  32.6 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  41.04 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  34.44 
 
 		 302 aa  52.4  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  28.05 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  34.01 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  35.33 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  31.52 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.57 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  33.57 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  27.61 
 
 		 300 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.34 
 
 		 303 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  36.42 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.88 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  31.16 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  31.16 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  31.16 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  29.63 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  29.41 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  30.29 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.26 
 
 		 309 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  27.44 
 
 		 263 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  27.08 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  34.1 
 
 		 288 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.82 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  31.28 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  30.71 
 
 		 303 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  33.33 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  45.95 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  33.53 
 
 		 288 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.51 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.51 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  30 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  29.46 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  30.19 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  28.42 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  27.68 
 
 		 304 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  31.82 
 
 		 309 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  32.12 
 
 		 291 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.81 
 
 		 308 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  32.69 
 
 		 300 aa  45.8  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  32.95 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  35.22 
 
 		 166 aa  45.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  30 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  27.68 
 
 		 304 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3806  A24 family peptidase  30.59 
 
 		 155 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000259026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  32.85 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  30.32 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.33 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  37.5 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  40.79 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  27.68 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  31.69 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  27.68 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  34.29 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3012  peptidase A24A, prepilin type IV  34.31 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.16 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  28.81 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  32.88 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  32.39 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1136  peptidase A24A domain-containing protein  47.3 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  40.28 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1221  peptidase A24A domain-containing protein  29.01 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.544367  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  26.88 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1459  late competence protein comC  35.23 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  39.19 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1419  late competence protein comC  34.09 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1199  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  33.33 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.19 
 
 		 287 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  34.67 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4646  peptidase, A24 (type IV prepilin peptidase) family  30.43 
 
 		 155 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000049764  normal  0.0336249 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.19 
 
 		 287 aa  42.4  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  39.19 
 
 		 274 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  26.01 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3529  type 4 prepilin peptidase  31.43 
 
 		 225 aa  42.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.645409  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03186  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  31.43 
 
 		 225 aa  42  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  33.33 
 
 		 294 aa  42  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03137  hypothetical protein  31.43 
 
 		 225 aa  42  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0378  peptidase A24A prepilin type IV  31.43 
 
 		 225 aa  42  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>