More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0808 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0808  inner-membrane translocator  100 
 
 		 353 aa  692    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.308747  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2712  inner-membrane translocator  36.53 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5041  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.63 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3344  inner-membrane translocator  37.77 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6410  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 346 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197566  normal  0.503091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4515  Monosaccharide-transporting ATPase  34.95 
 
 		 346 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00130543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3886  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1812  inner-membrane translocator  39.81 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0354893  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3930  monosaccharide-transporting ATPase  36.33 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.612132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3689  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0764  ribose ABC transporter, permease  36.46 
 
 		 349 aa  184  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.228645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2344  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0936841  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1594  monosaccharide-transporting ATPase  38.71 
 
 		 354 aa  177  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.723616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0680  inner-membrane translocator  39.81 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  30.49 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  30.12 
 
 		 332 aa  150  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  29.41 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  31.6 
 
 		 350 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.88 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.55 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  31.17 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.22 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.22 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  32.89 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  31.58 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  31.58 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.98 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  32.21 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0843  Monosaccharide-transporting ATPase  29.57 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  29.97 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0101  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.832216  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  31.21 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0663  monosaccharide-transporting ATPase  30.42 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  28.85 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  30.09 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0659  ribose ABC transporter, permease  30.42 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.717922  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  30.09 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  30.09 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5156  inner-membrane translocator  31.7 
 
 		 330 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 		 346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  29.26 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  32.03 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  30 
 
 		 331 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  31.33 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  27.85 
 
 		 310 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  30.07 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  28.39 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  29.3 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  30.89 
 
 		 316 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5307  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  31.23 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167667  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0548  L-arabinose transporter permease protein  29.32 
 
 		 338 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0287231  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  30.61 
 
 		 383 aa  126  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  30.97 
 
 		 348 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  29.82 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  29.9 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  29.47 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  31.47 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  31.25 
 
 		 322 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0524  L-arabinose transporter permease protein  28.99 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299001  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  29.47 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  31.99 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2762  L-arabinose transporter permease protein  29.51 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.84256  normal  0.399817 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  27.55 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  28.21 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3705  L-arabinose transporter permease protein  28.99 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0548  L-arabinose transporter permease protein  28.85 
 
 		 338 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0318738  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  29.52 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  29.52 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3602  L-arabinose transporter permease protein  31.63 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  30.65 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  32.75 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.22 
 
 		 345 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  28.57 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  29.52 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  30.63 
 
 		 334 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 350 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 345 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3409  L-arabinose transporter permease protein  28.52 
 
 		 338 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0925142  normal  0.0828764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>