60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1947 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  51.96 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  49.03 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  37.29 
 
 		 309 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  33.56 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  35.28 
 
 		 325 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  34.74 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  35.71 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  36.64 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  35.45 
 
 		 346 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1200  hypothetical protein  35.56 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  37.89 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  29.55 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  31.42 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  33.58 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  28.03 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  28.91 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0057  integral membrane protein  31.94 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  28.68 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  31.29 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  27.49 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  26.91 
 
 		 386 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  23.64 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  25.4 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  28.74 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  26.51 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  30.93 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  25.4 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  25.76 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  24.8 
 
 		 334 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  24.72 
 
 		 340 aa  52.4  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  21.72 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  29.36 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  24.83 
 
 		 346 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  28.14 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  28.45 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  25.7 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  25.2 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  25.59 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 		 586 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  24.29 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  31.43 
 
 		 873 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  28.3 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  26.78 
 
 		 859 aa  47  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4038  hypothetical protein  25.17 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2780  hypothetical protein  29.21 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  27.11 
 
 		 803 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  36.27 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  30.38 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  25.93 
 
 		 793 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  24.19 
 
 		 350 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  25.88 
 
 		 773 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  27.11 
 
 		 795 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1180  hypothetical protein  44.26 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  26.96 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  27.27 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  27.41 
 
 		 396 aa  42.7  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  26.67 
 
 		 783 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  26.09 
 
 		 332 aa  42.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  31.4 
 
 		 851 aa  42.4  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>