38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1180 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1180  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  528  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
586 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2616  hypothetical protein  28.96 
 
 
314 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000148411  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  23.25 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  26.67 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  22.27 
 
 
321 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  28.19 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  23.51 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  24.56 
 
 
341 aa  55.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  30.25 
 
 
351 aa  55.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  26.32 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  30.65 
 
 
378 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  26.15 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  24.43 
 
 
360 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  27.19 
 
 
319 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  25.6 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  29.6 
 
 
370 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  32.74 
 
 
329 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  41.38 
 
 
362 aa  49.3  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  27.44 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  21.82 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  30 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  24.32 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.76 
 
 
775 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2265  hypothetical protein  31.94 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  24.4 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  25.53 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  25.45 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  25.53 
 
 
339 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  23.17 
 
 
385 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  22.87 
 
 
304 aa  43.9  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  31.32 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2780  hypothetical protein  45.24 
 
 
333 aa  43.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  18.92 
 
 
340 aa  43.1  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  25.19 
 
 
340 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  27.71 
 
 
339 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  30.28 
 
 
313 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  20.5 
 
 
574 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>