37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1692 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  776    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  26.32 
 
 
340 aa  95.9  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  23.58 
 
 
338 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  22.87 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  24.92 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  23.56 
 
 
340 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  24.77 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  22.77 
 
 
347 aa  63.5  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  22.46 
 
 
342 aa  63.2  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  23.58 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1980  hypothetical protein  23.45 
 
 
341 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  24.56 
 
 
1195 aa  53.5  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  21.75 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  20.85 
 
 
341 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  20.38 
 
 
339 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  24.64 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  20.3 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  25.21 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  25.59 
 
 
315 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  26.39 
 
 
337 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  24.51 
 
 
349 aa  47  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  23.1 
 
 
337 aa  47.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  33.73 
 
 
345 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  20.8 
 
 
343 aa  46.6  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  20.8 
 
 
338 aa  46.6  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  27.43 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  24.56 
 
 
348 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2298  hypothetical protein  18.58 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  24.8 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  21.58 
 
 
392 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  18.97 
 
 
339 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  25.38 
 
 
322 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  20 
 
 
333 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  19.34 
 
 
330 aa  43.1  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  24.1 
 
 
347 aa  43.1  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  20.2 
 
 
329 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  24.69 
 
 
386 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>