277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1640 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1640  K+ transport systems NAD-binding component, TrkA-N  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0547  K+ transport systems NAD-binding subunit  31.28 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3913  TrkA domain-containing protein  29.58 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.554723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  28.17 
 
 		 443 aa  86.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  24.66 
 
 		 465 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  27.48 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  21.72 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  26.01 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  21.72 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  25.62 
 
 		 445 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  27.4 
 
 		 454 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  28.92 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  21.72 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  24.77 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  28.44 
 
 		 458 aa  79  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  21.96 
 
 		 449 aa  78.6  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 		 452 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1114  potassium transporter peripheral membrane component  27.98 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  24.04 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  27.52 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  20.81 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  23.58 
 
 		 450 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  28.89 
 
 		 458 aa  75.9  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  26.24 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  23.74 
 
 		 454 aa  75.9  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  22.03 
 
 		 445 aa  75.5  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  20.78 
 
 		 449 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  24.77 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  23.39 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  25.81 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  27.52 
 
 		 459 aa  71.6  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  20.48 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  28.16 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  21.3 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  25.23 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  25.11 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  23.85 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  23.15 
 
 		 448 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  20.59 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  25.57 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3183  potassium transporter peripheral membrane component  23.39 
 
 		 465 aa  68.2  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00657284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  27.56 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  24.43 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  29.61 
 
 		 458 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  26.05 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  23.45 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  27.43 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  25.35 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  24.55 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  24.55 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  24.55 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  26.11 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0890  TrkA-C domain protein  23.4 
 
 		 446 aa  65.9  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220881  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  24.42 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  23.42 
 
 		 452 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  27.8 
 
 		 457 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  22.13 
 
 		 454 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  21.76 
 
 		 448 aa  65.1  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  27.32 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  28.08 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  22.97 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  25.23 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  28.64 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  27.73 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  24.17 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  27.43 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.16 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  24.41 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  27.73 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  24.64 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  27.73 
 
 		 457 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  24.4 
 
 		 467 aa  62  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  26.09 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  23.11 
 
 		 445 aa  62  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  23.9 
 
 		 458 aa  61.6  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  26.82 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2242  potassium transporter peripheral membrane component  24.67 
 
 		 458 aa  61.6  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0521644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1209  potassium transporter peripheral membrane component  25.48 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  23.04 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  23.64 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  27.27 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  27.27 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  21.28 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  23.41 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  23.15 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  23.72 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  25.37 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  22.48 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  22.48 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  22.48 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  26.34 
 
 		 457 aa  59.7  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0108  potassium transporter peripheral membrane component  21.78 
 
 		 462 aa  58.9  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  24.15 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  24.26 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  24.17 
 
 		 469 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  24.17 
 
 		 469 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  24.17 
 
 		 469 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  24.17 
 
 		 469 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>