More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0279 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 386 aa  793    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  57.61 
 
 		 398 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  57.84 
 
 		 393 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  56.56 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  55.53 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  55.87 
 
 		 393 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  54.62 
 
 		 393 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  55.61 
 
 		 405 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  55.61 
 
 		 405 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  55.61 
 
 		 405 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  56.41 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  53.83 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  54.24 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  54.43 
 
 		 368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  54.12 
 
 		 418 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  54.62 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  52.55 
 
 		 421 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.38 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  51.17 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  54.38 
 
 		 409 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  51.8 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  52.79 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  49.13 
 
 		 409 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  49.62 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  51.69 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  51.94 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  47.03 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  51.03 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  50.5 
 
 		 406 aa  363  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  50.9 
 
 		 382 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  49.25 
 
 		 405 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  50 
 
 		 374 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  47.95 
 
 		 369 aa  358  9.999999999999999e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.48 
 
 		 349 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  50.64 
 
 		 381 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  49.37 
 
 		 370 aa  354  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  48.71 
 
 		 388 aa  354  1e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  51.05 
 
 		 375 aa  353  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  46.97 
 
 		 372 aa  353  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  47.73 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  48.2 
 
 		 370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  48.64 
 
 		 410 aa  352  7e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.22 
 
 		 349 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  48.18 
 
 		 370 aa  349  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  48.43 
 
 		 375 aa  349  5e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  47.9 
 
 		 378 aa  348  9e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  49.61 
 
 		 368 aa  348  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  46.95 
 
 		 367 aa  346  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  46.95 
 
 		 367 aa  346  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  46.51 
 
 		 371 aa  346  5e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  47.85 
 
 		 368 aa  346  5e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  48.31 
 
 		 375 aa  345  6e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 369 aa  345  6e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  46.23 
 
 		 369 aa  345  7e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  47.19 
 
 		 365 aa  345  8e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  47.19 
 
 		 365 aa  345  8e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  47.03 
 
 		 366 aa  345  1e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  48.33 
 
 		 375 aa  344  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 		 406 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  47.16 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  46.55 
 
 		 385 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  46.53 
 
 		 373 aa  345  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  46.94 
 
 		 380 aa  344  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  48.59 
 
 		 367 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  45.94 
 
 		 384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  47.16 
 
 		 416 aa  343  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  46.53 
 
 		 374 aa  343  4e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  47.42 
 
 		 366 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  47.68 
 
 		 370 aa  342  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  46.8 
 
 		 364 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  46.06 
 
 		 374 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  49.25 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  48.34 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  44.9 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  47.18 
 
 		 383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2735  ABC transporter related  48.95 
 
 		 370 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0804319  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  46.53 
 
 		 367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  48.28 
 
 		 368 aa  339  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  46.79 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  48.05 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.17 
 
 		 376 aa  339  5e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  47.19 
 
 		 370 aa  339  5e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 367 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  45.34 
 
 		 367 aa  338  7e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.16 
 
 		 366 aa  338  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  45.66 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 364 aa  337  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.52 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.52 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.52 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.52 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.52 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  46.25 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  48.06 
 
 		 354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  46.43 
 
 		 371 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 		 371 aa  336  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>