More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4018 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3938  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  79.29 
 
 
400 aa  644    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4018  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  100 
 
 
396 aa  812    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0206  Formyl-CoA transferase  39.45 
 
 
393 aa  276  4e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.640391 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1851  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.44 
 
 
404 aa  274  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.990249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.34 
 
 
395 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1329  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.11 
 
 
423 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.94269  normal  0.646992 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2154  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.48 
 
 
413 aa  256  4e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.575353  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2211  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.06 
 
 
426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.859864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3621  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.33 
 
 
388 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4014  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.75 
 
 
399 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0683  Formyl-CoA transferase  35.55 
 
 
416 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521571  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0034  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.41 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4672  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.9 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00203708  normal  0.032071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3005  putative L-carnitine dehydratase/bileacid- inducible protein F  34.26 
 
 
405 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4152  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.41 
 
 
395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4040  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.41 
 
 
395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3480  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.97 
 
 
406 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  35.99 
 
 
396 aa  241  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1531  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.11 
 
 
400 aa  239  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3771  Formyl-CoA transferase  34.55 
 
 
395 aa  239  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.292423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2142  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.49 
 
 
446 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.58 
 
 
416 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3615  Formyl-CoA transferase  35.19 
 
 
399 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.130892  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2070  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.76 
 
 
409 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840357  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5109  putative L-carnitine dehydrogenase  34.47 
 
 
408 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367445  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0187  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.33 
 
 
401 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.944742  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0061  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.57 
 
 
401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.603541  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0289  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.85 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158157  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6904  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.47 
 
 
413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733868  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3203  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.76 
 
 
406 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.303388  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2408  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.47 
 
 
418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4958  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.16 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155213  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5877  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.64 
 
 
422 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2771  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.44 
 
 
405 aa  233  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2206  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.8 
 
 
415 aa  233  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2196  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.52 
 
 
434 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3093  Formyl-CoA transferase  34.34 
 
 
402 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0159656  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0642  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.65 
 
 
395 aa  232  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.440176  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4160  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.32 
 
 
407 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2980  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.22 
 
 
418 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0114  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.05 
 
 
381 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.112349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3495  Formyl-CoA transferase  34.09 
 
 
402 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.36601  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0110  putative caiB/baiF CoA-transferase family protein  32.32 
 
 
400 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6415  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.78 
 
 
394 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.835321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2908  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.5 
 
 
411 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1463  putative acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase  36.05 
 
 
381 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4145  acyl-CoA transferase/L-carnitine dehydratase CaiB  34.68 
 
 
414 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0869104  normal  0.342052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2036  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.42 
 
 
390 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.402932  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.93 
 
 
450 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1069  CaiB/BaiF family protein  35.93 
 
 
411 aa  229  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3087  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.08 
 
 
411 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1436  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.75 
 
 
401 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5106  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.55 
 
 
407 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.912284  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5625  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.91 
 
 
415 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344287  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0119  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.97 
 
 
413 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391223  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3300  acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase  36.11 
 
 
389 aa  229  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4272  Formyl-CoA transferase  32.81 
 
 
393 aa  229  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0133  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.17 
 
 
428 aa  229  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1900  CAIB/BAIF family protein  35.2 
 
 
401 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894155  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1550  hypothetical protein  33.75 
 
 
395 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602159  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6435  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.71 
 
 
415 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2484  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.25 
 
 
407 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0601081  normal  0.0181338 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2884  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.42 
 
 
400 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8312  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.84 
 
 
425 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0250341  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0905  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.57 
 
 
410 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.36953  normal  0.0364065 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3456  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.25 
 
 
392 aa  227  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00954792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5761  putative Formyl-coenzyme A transferase (Formyl-CoA transferase  35.88 
 
 
422 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2770  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.03 
 
 
410 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68571  normal  0.674174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3426  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.68 
 
 
403 aa  227  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0143  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.31 
 
 
413 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0173  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.87 
 
 
433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0047  Formyl-CoA transferase  35.78 
 
 
412 aa  226  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386629  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5950  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.04 
 
 
386 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12278  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3421  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.25 
 
 
416 aa  226  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0265  Alpha-methylacyl-CoA racemase  34.96 
 
 
408 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125421  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  34.76 
 
 
413 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1735  Formyl-CoA transferase  36.46 
 
 
448 aa  226  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1595  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.73 
 
 
390 aa  225  9e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6256  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.92 
 
 
406 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326861  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.29 
 
 
406 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1831  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.25 
 
 
414 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00867179  normal  0.544825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4069  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.83 
 
 
426 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1310  Alpha-methylacyl-CoA racemase  35.12 
 
 
406 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2729  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.92 
 
 
395 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0558  Formyl-CoA transferase  36.02 
 
 
396 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1084  CAIB/BAIF family protein  35.62 
 
 
381 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.254633  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3269  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.12 
 
 
368 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1045  CAIB/BAIF family protein  35.62 
 
 
381 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372992  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2169  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.97 
 
 
381 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2177  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.51 
 
 
403 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0039  Formyl-CoA transferase  35.63 
 
 
406 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3791  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.98 
 
 
407 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2624  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.42 
 
 
399 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2159  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.26 
 
 
403 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5918  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.26 
 
 
403 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3594  hypothetical protein  35.92 
 
 
439 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903396  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3486  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.34 
 
 
420 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.290572 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5468  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.51 
 
 
398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105901  normal  0.979191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4086  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.21 
 
 
390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1225  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.42 
 
 
382 aa  223  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0131268  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>