46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2925 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  100 
 
 		 94 aa  186  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  82.61 
 
 		 93 aa  154  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  42.47 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 79 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3174  AbrB family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2538  AbrB family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0127066  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3222  AbrB family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0976  transcriptional regulator, AbrB family  51.06 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.73143  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3166  AbrB family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3513  transcriptional regulator, AbrB family  43.37 
 
 		 87 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.674583 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1458  transcriptional regulator, AbrB family  47.83 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.75174  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2044  AbrB family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3009  AbrB family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  35.06 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0687  AbrB family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000068736  unclonable  0.00000000733097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2127  AbrB family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2120  AbrB family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.181365  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0037  AbrB family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000106166  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25030  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  39.13 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0446  transcriptional regulator AbrB  36.49 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627341  normal  0.288224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0720  transcriptional regulator, AbrB family  43.18 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.032212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1521  transcriptional regulator, AbrB family  51.16 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2133  AbrB family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116838  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3733  transcriptional regulator, AbrB family  63.33 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0338094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 128 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2400  transcriptional regulator, AbrB family  60.71 
 
 		 82 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.303148  hitchhiker  0.00489815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1921  AbrB family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 84 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  59.26 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1219  transcriptional regulator, AbrB family  32.94 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3218  transcriptional regulator, AbrB family  64.29 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55751 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  43.59 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1648  AbrB family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.756068  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2716  transcriptional regulator, AbrB family  38.37 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0876689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0316  AbrB family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1205  hypothetical protein  65.38 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.293746  normal  0.764291 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0616  AbrB family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175796 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3006  AbrB family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  48.78 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1976  regulators of stationary/sporulation gene expression  53.12 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3101  transcriptional regulator, AbrB family  48.65 
 
 		 90 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0560  transcriptional regulator, AbrB family  48.65 
 
 		 90 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.052121  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 128 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>