More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1461 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1461  ABC transporter transmembrane region  100 
 
 
352 aa  719    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  78.4 
 
 
639 aa  413  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  61.89 
 
 
678 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  57.43 
 
 
645 aa  301  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  45.08 
 
 
629 aa  229  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  45.99 
 
 
638 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  44.94 
 
 
648 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  43.27 
 
 
651 aa  207  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  43.44 
 
 
660 aa  196  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
658 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  39.52 
 
 
650 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  43.9 
 
 
644 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  29.39 
 
 
718 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  32.35 
 
 
585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  26.91 
 
 
590 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  27.85 
 
 
590 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  26.94 
 
 
590 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  26.91 
 
 
590 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  25.75 
 
 
591 aa  102  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  31.28 
 
 
589 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  29.18 
 
 
601 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  27.68 
 
 
596 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  24.35 
 
 
602 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  25.33 
 
 
596 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  23.83 
 
 
596 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  25.2 
 
 
596 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  27.52 
 
 
596 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  27.45 
 
 
601 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  26.29 
 
 
625 aa  93.6  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  25.1 
 
 
601 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  26.2 
 
 
619 aa  92.8  9e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  25.1 
 
 
601 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  26.34 
 
 
620 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  20.85 
 
 
603 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  26.98 
 
 
575 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  27.17 
 
 
595 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  26.67 
 
 
602 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  30.57 
 
 
733 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.42 
 
 
702 aa  77.4  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.36 
 
 
677 aa  76.3  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.42 
 
 
691 aa  76.3  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  23.08 
 
 
594 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  28.87 
 
 
601 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.8 
 
 
598 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3251  ABC transporter related  29.01 
 
 
675 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135546  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  27.52 
 
 
586 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.34 
 
 
721 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.67 
 
 
670 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.32 
 
 
598 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  24.61 
 
 
606 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  29.05 
 
 
663 aa  73.9  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  32.06 
 
 
1218 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  32.06 
 
 
1218 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  27.08 
 
 
661 aa  72.8  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  31.3 
 
 
1218 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  31.3 
 
 
1218 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  27.66 
 
 
641 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  31.3 
 
 
1218 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  28.1 
 
 
649 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  23.05 
 
 
607 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.42 
 
 
598 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  25.48 
 
 
666 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  25.26 
 
 
598 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  23.78 
 
 
614 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  27.41 
 
 
611 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.6 
 
 
598 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  26.01 
 
 
600 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  27.66 
 
 
672 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  31.78 
 
 
609 aa  70.1  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  25.68 
 
 
588 aa  69.7  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8971  ABC transporter related protein  28.25 
 
 
623 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.33 
 
 
587 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.63 
 
 
598 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  25.5 
 
 
597 aa  69.3  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  22.8 
 
 
603 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  22.17 
 
 
595 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  26.21 
 
 
587 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  21.51 
 
 
611 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  25.5 
 
 
597 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  22.31 
 
 
635 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  25.79 
 
 
597 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  26.04 
 
 
605 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  27.5 
 
 
587 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11298  drug ABC transporter ATP-binding protein  27.66 
 
 
631 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  25.49 
 
 
652 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  26.09 
 
 
588 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  24.71 
 
 
695 aa  67.4  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  26.09 
 
 
598 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.09 
 
 
598 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  26.67 
 
 
587 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.09 
 
 
598 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.67 
 
 
587 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  22.17 
 
 
581 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0858  ABC transporter, transmembrane region  25.64 
 
 
680 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.438545  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  26.76 
 
 
619 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.09 
 
 
598 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.67 
 
 
587 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  26.67 
 
 
587 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  26.67 
 
 
587 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  25.91 
 
 
592 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>