234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4394 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4394  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 
296 aa  587  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2753  cell wall hydrolase/autolysin  59.36 
 
 
254 aa  275  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.984252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9001  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase-like protein  50.66 
 
 
283 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0290  cell wall hydrolase/autolysin  54.46 
 
 
283 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3352  cell wall hydrolase/autolysin  54.79 
 
 
290 aa  228  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.939997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1357  cell wall hydrolase/autolysin  53.99 
 
 
286 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.414025  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5160  cell wall hydrolase/autolysin  53.05 
 
 
291 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1163  cell wall hydrolase/autolysin  47.6 
 
 
301 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4160  cell wall hydrolase/autolysin  48.42 
 
 
259 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00486305  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0671  cell wall hydrolase/autolysin  45.37 
 
 
320 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5529  cell wall hydrolase/autolysin  41.31 
 
 
246 aa  175  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13749  hypothetical protein  42.72 
 
 
241 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.369485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4905  cell wall hydrolase/autolysin  38.81 
 
 
251 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0385715  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4994  cell wall hydrolase/autolysin  38.81 
 
 
251 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5273  cell wall hydrolase/autolysin  38.81 
 
 
251 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467188  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4010  cell wall hydrolase/autolysin  41.44 
 
 
254 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1286  cell wall hydrolase/autolysin  37.79 
 
 
245 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3402  cell wall hydrolase/autolysin  37.5 
 
 
347 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1398  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  35.39 
 
 
241 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4521  cell wall hydrolase/autolysin  32.83 
 
 
318 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2975  cell wall hydrolase/autolysin  33.71 
 
 
463 aa  87.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0111  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.68 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0171096  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0113  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  28.77 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.95 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1807  cell wall hydrolase/autolysin  27.23 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.05 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.344171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3223  cell wall hydrolase/autolysin  28.9 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2296  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.86 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.62 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0926  cell wall hydrolase/autolysin  27.23 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0859  cell wall hydrolase/autolysin  27.27 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.751216 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  28.19 
 
 
627 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000155726  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1466  cell wall hydrolase/autolysin  28.51 
 
 
627 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000100817  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1534  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.02 
 
 
562 aa  66.2  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0577934  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1798  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.41 
 
 
623 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2268  cell wall hydrolase/autolysin  24.67 
 
 
585 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0866  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.41 
 
 
412 aa  62.4  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139466  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0332  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.8 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000783569  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1709  cell wall hydrolase/autolysin  27.2 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.11 
 
 
471 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  26.22 
 
 
451 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2080  cell wall hydrolase/autolysin  24.42 
 
 
274 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000802973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1804  cell wall hydrolase/autolysin  27.57 
 
 
240 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0213  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.16 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00242661  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0604  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.03 
 
 
612 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594044  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0589  cell wall hydrolase/autolysin  27.03 
 
 
612 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  23.39 
 
 
268 aa  58.9  0.00000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000536287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.27 
 
 
476 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0588  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.47 
 
 
315 aa  58.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0964307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0071  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.98 
 
 
238 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000157753  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2148  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.17 
 
 
522 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3244  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.12 
 
 
815 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4550  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.61 
 
 
375 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1825  cell wall hydrolase/autolysin  26.13 
 
 
590 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0910  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.64 
 
 
402 aa  57  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0182815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.43 
 
 
616 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0864  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.16 
 
 
476 aa  56.2  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0915  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.75 
 
 
422 aa  55.8  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.237056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0986  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.61 
 
 
529 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.46837e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0851  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.61 
 
 
529 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000657012  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4053  cell wall hydrolase/autolysin  24.32 
 
 
585 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.630004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.61 
 
 
529 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000140449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1272  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.22 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000305091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2729  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.89 
 
 
436 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.3202  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2589  cell wall hydrolase/autolysin  26.01 
 
 
188 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2267  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.53 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.73 
 
 
382 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0940  S-layer protein  26.41 
 
 
535 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000994264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1079  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.18 
 
 
529 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000334554  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1823  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.9 
 
 
422 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0998056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.05 
 
 
706 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.88 
 
 
619 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00159133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  26.36 
 
 
538 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1194  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00764454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0800  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.18 
 
 
529 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000328713  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0861  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.85 
 
 
631 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000195536  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2317  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.19 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1064  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.38 
 
 
190 aa  53.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000172144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4391  S-layer protein  26.41 
 
 
535 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000169647  unclonable  1.31184e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.42 
 
 
474 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2134  cell wall hydrolase/autolysin  25.75 
 
 
349 aa  53.1  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.373316  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0892  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.17 
 
 
568 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.105159  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0725  cell wall hydrolase/autolysin  25.86 
 
 
520 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00509624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1578  cell wall hydrolase/autolysin  25.81 
 
 
240 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36346  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2360  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.78 
 
 
344 aa  52.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.26107  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  24.04 
 
 
352 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2753  hypothetical protein  26.15 
 
 
476 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1080  cell wall hydrolase/autolysin  24.27 
 
 
703 aa  52.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000496227  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3028  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.34 
 
 
435 aa  52.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0809739  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.06 
 
 
746 aa  52.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2626  hypothetical protein  26.15 
 
 
476 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.91 
 
 
448 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.39 
 
 
657 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1654  cell wall hydrolase/autolysin  22.91 
 
 
239 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.97 
 
 
352 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.34 
 
 
860 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2281  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.71 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442752  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0254  cell wall hydrolase/autolysin  25.91 
 
 
604 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.15 
 
 
907 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0650  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.76 
 
 
525 aa  51.2  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.53324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>