59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3865 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 		 256 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2532  putative transferase  74.6 
 
 		 248 aa  335  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.501496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1356  hypothetical protein  57.81 
 
 		 255 aa  263  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4106  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  61.24 
 
 		 273 aa  261  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0724  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  55.47 
 
 		 252 aa  241  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0234294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0521  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.56 
 
 		 655 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.63 
 
 		 530 aa  65.5  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.67 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4110  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.9 
 
 		 507 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  30.56 
 
 		 537 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1206  hypothetical protein  26.63 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.93 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.66 
 
 		 190 aa  52.8  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.93 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0720  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.73 
 
 		 499 aa  52  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865799 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0213  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.98 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.6 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0433  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 		 650 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.63 
 
 		 319 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.91 
 
 		 231 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.91 
 
 		 231 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  30.6 
 
 		 233 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.91 
 
 		 231 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.47 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.56 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  26.17 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.81 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  32.59 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.91 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  31.43 
 
 		 525 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  32.14 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.23 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1194  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.03 
 
 		 311 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.2 
 
 		 194 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1803  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.216212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2259  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  42.25 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.63 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.63 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  33.67 
 
 		 193 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.83 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.44 
 
 		 397 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2856  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.96 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0539352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.68 
 
 		 204 aa  43.5  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3305  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.58 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.08 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.91 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1786  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.13 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.74 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00859125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.18 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2359  hypothetical protein  36.05 
 
 		 359 aa  42.7  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278145  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.91 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.91 
 
 		 229 aa  42  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.91 
 
 		 229 aa  42  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.91 
 
 		 229 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.91 
 
 		 229 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.91 
 
 		 229 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  33.67 
 
 		 193 aa  42  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>