More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3792 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3792  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
418 aa  818    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  0.102033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1083  protein of unknown function DUF214  31.24 
 
 
407 aa  139  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2493  protein of unknown function DUF214  30.21 
 
 
401 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  26.78 
 
 
402 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1955  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 
406 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.173314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0469  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 
405 aa  94  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  23 
 
 
400 aa  90.9  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  26.14 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.5 
 
 
417 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  25.7 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2509  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 
399 aa  89  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  25.7 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 
397 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.26 
 
 
385 aa  87  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  25.47 
 
 
405 aa  86.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  22.7 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.99 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  22.96 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  24.18 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  23.7 
 
 
391 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  22.92 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  23.64 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  20.89 
 
 
408 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  24.66 
 
 
383 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  23.38 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  23.38 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  25.58 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  23.38 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  23.38 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  30.94 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  23.38 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  23.42 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  22.66 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  22.56 
 
 
443 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  24.77 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  24.71 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  24 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  27.29 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  23 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  27.29 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  23.99 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  23.13 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  25.28 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  25.32 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.72 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.15 
 
 
437 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0016  ABC transporter, permease protein  24.33 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2283  permease, putative  23.99 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.14949  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  27.27 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  23.15 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  22.71 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  25.06 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  33.76 
 
 
408 aa  76.3  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  23.08 
 
 
410 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  24.58 
 
 
383 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  24.68 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  24.83 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  26.69 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  25.41 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  23.62 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  22.85 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  25.69 
 
 
666 aa  73.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  22.44 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  22.51 
 
 
414 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  24.07 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  30.46 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  23.53 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  22.25 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  24.46 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  24.1 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  24.6 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 
443 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  24.06 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  27.45 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  31.78 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  25.33 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  23.28 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  20.88 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  24.27 
 
 
647 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  24.72 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4788  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 
408 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123096  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1761  hypothetical protein  24.94 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000119528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.6 
 
 
656 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  22.51 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  20.28 
 
 
642 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.86 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  22.15 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1486  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0390909  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.29 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  23.62 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  26.06 
 
 
412 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  22.1 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  23.9 
 
 
656 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>