44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2164 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2164  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  380  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  0.0672199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5337  putative transcriptional regulator, TetR family  72.36 
 
 		 215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2870  transcriptional regulator, TetR family  68.72 
 
 		 197 aa  249  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0570859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4140  TetR family transcriptional regulator  67.35 
 
 		 200 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1759  TetR family transcriptional regulator  66.33 
 
 		 199 aa  240  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5295  transcriptional regulator, TetR family  58.95 
 
 		 189 aa  191  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2383  transcriptional regulator, TetR family  56.15 
 
 		 193 aa  174  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4093  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370117  normal  0.493128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5342  putative transcriptional regulator, TetR family  37.44 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.744613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  39.55 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  34.67 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 141 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 202 aa  44.7  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 333 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 307 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  43.75 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  36.07 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 168 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 207 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 225 aa  41.6  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 229 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 211 aa  41.2  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>