More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1568 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1568  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
140 aa  263  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0256186 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2798  putative signal transduction protein with CBS domains  50.37 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0139355  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3788  putative signal transduction protein with CBS domains  50 
 
 
139 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.534948  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  43.88 
 
 
139 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  44.12 
 
 
138 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  44.85 
 
 
138 aa  104  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  43.94 
 
 
141 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  35.82 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  45.52 
 
 
139 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  43.07 
 
 
138 aa  97.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  44.17 
 
 
139 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  35.07 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  39.71 
 
 
142 aa  94  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  38.14 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  40 
 
 
141 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  45.3 
 
 
142 aa  89.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  36.3 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  38.4 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.79 
 
 
141 aa  87.8  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  35.48 
 
 
141 aa  86.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  39.57 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  36.89 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  41.38 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  33.59 
 
 
207 aa  85.5  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2667  hypothetical protein  38.06 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.262704  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  37.19 
 
 
139 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 
157 aa  84.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  38.97 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  38.46 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  39.68 
 
 
139 aa  83.6  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.76 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  36.43 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  36.28 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.61 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  33.33 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  40.87 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  38.02 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  35.4 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  41.6 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  35.4 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5147  putative signal transduction protein with CBS domains  36.89 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  33.9 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  40.68 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  36.36 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  35.4 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  31.93 
 
 
188 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  42.11 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  39.47 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  35.4 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  35.4 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  47.47 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1978  putative signal transduction protein with CBS domains  34.96 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0602672  normal  0.871895 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  40.71 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  39.02 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  35.4 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  36.84 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  41.44 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0607  signal-transduction protein  34.4 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.150713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  34.51 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  40 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  33.59 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  34.51 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  41.67 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0945  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 
144 aa  77  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.678646  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  40.97 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  31.97 
 
 
143 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  37.12 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  34.45 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  38.46 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  39.47 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  41.3 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  39.83 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  41.3 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  35.61 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  41.3 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  42.86 
 
 
236 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  30 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  39.1 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  35.71 
 
 
769 aa  73.9  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  35.04 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  32.77 
 
 
186 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3011  putative signal transduction protein with CBS domains  40.52 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  35.9 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  29.1 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  38.02 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  34.65 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0778  signal transduction protein  29.31 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0404956 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2858  putative signal transduction protein with CBS domains  39.13 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
143 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3011  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162521  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  40.68 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354137 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  35.48 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  44.68 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1135  signal-transduction protein  31.06 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  32.77 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>