More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0714 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  100 
 
 		 449 aa  887    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  60.74 
 
 		 446 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  61.38 
 
 		 476 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  57.53 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  58.17 
 
 		 447 aa  494  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  58.2 
 
 		 447 aa  495  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  57.14 
 
 		 449 aa  498  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  59.91 
 
 		 450 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  59.41 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  59.91 
 
 		 457 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  56.18 
 
 		 435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  55.58 
 
 		 503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  55.43 
 
 		 442 aa  438  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  53.42 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  56.28 
 
 		 468 aa  420  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  55.41 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  60.45 
 
 		 569 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  56.25 
 
 		 473 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  43.56 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  47.1 
 
 		 473 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  43.93 
 
 		 506 aa  324  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  44.14 
 
 		 481 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  40.27 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  38.13 
 
 		 453 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  38.36 
 
 		 453 aa  297  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  38.13 
 
 		 453 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  38.13 
 
 		 453 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  38.13 
 
 		 453 aa  296  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  38.36 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  37.67 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  37.67 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  37.67 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  37.67 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  38.13 
 
 		 453 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  40.59 
 
 		 449 aa  282  7.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  40.45 
 
 		 461 aa  279  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  39.45 
 
 		 458 aa  273  6e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.87 
 
 		 454 aa  270  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  37.16 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  34.4 
 
 		 452 aa  243  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  36.93 
 
 		 570 aa  220  3.9999999999999997e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.34 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  44.05 
 
 		 579 aa  208  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.05 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  35.85 
 
 		 474 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  39.07 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.93 
 
 		 444 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  32.57 
 
 		 445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  34.57 
 
 		 444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  31.89 
 
 		 431 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  34.47 
 
 		 446 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.58 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  32.34 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  34.74 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.05 
 
 		 425 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.3 
 
 		 424 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  34.01 
 
 		 446 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  30.83 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  33.18 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  32.57 
 
 		 445 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.83 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  28.32 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  31.63 
 
 		 441 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  32.26 
 
 		 444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  31.28 
 
 		 431 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.65 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.69767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  32.96 
 
 		 456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  32.96 
 
 		 456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  32.19 
 
 		 446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  31.93 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  32.03 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  29.82 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.91 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  31.32 
 
 		 437 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  31.4 
 
 		 440 aa  163  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  32.88 
 
 		 456 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  31.32 
 
 		 437 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  31.99 
 
 		 442 aa  162  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  34.59 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  30 
 
 		 434 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  30.58 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  32.17 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  28.92 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  30.57 
 
 		 445 aa  161  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  33.85 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  31.17 
 
 		 439 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.52 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  33.42 
 
 		 444 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  32.05 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.37 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.75 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  30.55 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  32.27 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  33.72 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.66 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  32.7 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  33.72 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  33.72 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  27.74 
 
 		 425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.51 
 
 		 437 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>