More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4895 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4895  ABC transporter related  100 
 
 		 393 aa  764    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  43.01 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  42.12 
 
 		 359 aa  258  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  42.77 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  40.16 
 
 		 369 aa  256  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  40.58 
 
 		 409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  42.03 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  43.1 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.3 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  38.34 
 
 		 398 aa  250  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1959  ABC transporter for sugar ATP-binding protein  40.28 
 
 		 367 aa  249  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133693  normal  0.34648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  38.7 
 
 		 404 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  40.7 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  36.44 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  36.44 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5458  ABC transporter related  45.74 
 
 		 416 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  41.41 
 
 		 367 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  40.17 
 
 		 371 aa  246  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.58 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 399 aa  245  8e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  42.45 
 
 		 371 aa  245  9e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.21 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  40.68 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  41.29 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0077  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.34 
 
 		 365 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4987  ABC transporter related  40.58 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  38.36 
 
 		 370 aa  244  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  41.29 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  42.9 
 
 		 355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  38.72 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.29 
 
 		 349 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  37.71 
 
 		 370 aa  242  7e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  38.2 
 
 		 372 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  41.18 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3818  ABC transporter related  40.23 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  41.09 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.5 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  38.6 
 
 		 355 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  35.36 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  35.36 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  37.85 
 
 		 370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  38.5 
 
 		 364 aa  240  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  38.3 
 
 		 355 aa  239  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  42.58 
 
 		 374 aa  239  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  40.28 
 
 		 376 aa  239  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  35.22 
 
 		 410 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  39.89 
 
 		 367 aa  239  6.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  41.55 
 
 		 357 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.01 
 
 		 376 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.23 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  40 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  41.83 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  37.09 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  40.29 
 
 		 358 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  37.22 
 
 		 369 aa  237  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  40.17 
 
 		 371 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  40.34 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  40.34 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  40.34 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  40.9 
 
 		 361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  35.96 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  41.58 
 
 		 360 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 375 aa  236  6e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  41.58 
 
 		 360 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  43.89 
 
 		 374 aa  236  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  41.72 
 
 		 357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  38.6 
 
 		 406 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.78 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  36.59 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  39.66 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  37.5 
 
 		 385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  42.01 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  39.78 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  39.71 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  38.51 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  38.99 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  41.16 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  38.06 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  34.46 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  40.52 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  38.18 
 
 		 384 aa  234  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  41.76 
 
 		 360 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  41.49 
 
 		 378 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  41.39 
 
 		 368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  35.75 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  38.87 
 
 		 373 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  39.78 
 
 		 372 aa  233  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  42.7 
 
 		 403 aa  233  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  37.64 
 
 		 371 aa  232  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  38.4 
 
 		 362 aa  232  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  39.34 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  39.34 
 
 		 366 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0064  ABC transporter related  34.94 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  38.75 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  36.26 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  38.08 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1816  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  38.46 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  38.68 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  41.14 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>