More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4344 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 339 aa  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  47.75 
 
 		 341 aa  285  7e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  49.29 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  47.4 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  47.71 
 
 		 335 aa  255  6e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  45.86 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  46.69 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  44.55 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  43.62 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  42.76 
 
 		 317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  42.05 
 
 		 313 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  42.05 
 
 		 313 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  42.05 
 
 		 313 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  42.4 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  45.71 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  41.34 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  40.91 
 
 		 314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  42.55 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  41.95 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  40.99 
 
 		 317 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  43.6 
 
 		 309 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.42 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.3 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.28 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  41.49 
 
 		 315 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  41.98 
 
 		 311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.7 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  41.7 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  41.7 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.7 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  41.7 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.7 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.7 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  38.7 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  41.75 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  42.05 
 
 		 312 aa  208  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  42.12 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  39.74 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  41.64 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  42.18 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  41.53 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  40.93 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  44.96 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  44.58 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  41.28 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1894  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2401  amino acid ABC transporter periplasmic protein  40 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22921  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1686  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0566  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2264  cystine-binding periplasmic protein FliY  40 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1687  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  41.43 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  43.93 
 
 		 310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  43.51 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  43.51 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  43.51 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0734  cystine-binding periplasmic protein FliY  39.65 
 
 		 406 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  43.88 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4187  extracellular solute-binding protein  43.51 
 
 		 312 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  42.57 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  40.71 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.02 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  40.36 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  40.23 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  37.5 
 
 		 348 aa  182  7e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  37.59 
 
 		 734 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  29.45 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  33.33 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  29.34 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  32.22 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  32.22 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  32.22 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  32.22 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  32.22 
 
 		 266 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  30.67 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  32.22 
 
 		 266 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  32.22 
 
 		 266 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  30.42 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  32.22 
 
 		 266 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  32.22 
 
 		 266 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  32.22 
 
 		 266 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  31.38 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  31.17 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  26.33 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  31.38 
 
 		 266 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  31.38 
 
 		 266 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  30 
 
 		 265 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  27.35 
 
 		 266 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  27.35 
 
 		 266 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  27.35 
 
 		 266 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  30.92 
 
 		 268 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  28.62 
 
 		 320 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  28.93 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.02 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  27.78 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  27.38 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  27.38 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>