More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0917 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0917  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 649 aa  1232    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  40.22 
 
 		 503 aa  283  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02820  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  38.18 
 
 		 520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4583  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 		 518 aa  220  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.933507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  29.7 
 
 		 510 aa  187  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  28.38 
 
 		 517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0491  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 		 515 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 536 aa  182  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 		 544 aa  181  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  29.17 
 
 		 504 aa  177  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 502 aa  177  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.36 
 
 		 563 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.36 
 
 		 563 aa  176  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.36 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  27.14 
 
 		 569 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  29.44 
 
 		 508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.35 
 
 		 557 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.92 
 
 		 561 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03427  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.28 
 
 		 522 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.831251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3995  AMP-dependent synthetase and ligase  26.47 
 
 		 537 aa  174  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000737641  normal  0.189989 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.19 
 
 		 561 aa  174  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.4 
 
 		 582 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.19 
 
 		 563 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  30.37 
 
 		 526 aa  173  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.91 
 
 		 561 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.47 
 
 		 557 aa  173  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.03 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  27.75 
 
 		 522 aa  173  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.53 
 
 		 557 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.94 
 
 		 561 aa  173  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  26.51 
 
 		 543 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.68 
 
 		 513 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  27.11 
 
 		 559 aa  171  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 507 aa  171  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.29 
 
 		 553 aa  171  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.176827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 		 559 aa  170  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  26.1 
 
 		 561 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.1 
 
 		 561 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 		 559 aa  169  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.1 
 
 		 561 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  32.01 
 
 		 506 aa  170  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.1 
 
 		 561 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  32.55 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.1 
 
 		 561 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  26.1 
 
 		 561 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 		 506 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  26.1 
 
 		 583 aa  169  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.18 
 
 		 572 aa  169  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.1 
 
 		 583 aa  169  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3482  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.52 
 
 		 557 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194948  hitchhiker  0.00229302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.73 
 
 		 561 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.56 
 
 		 573 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.74 
 
 		 561 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  28.72 
 
 		 512 aa  167  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  30.34 
 
 		 503 aa  167  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  27.42 
 
 		 520 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.37 
 
 		 514 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 		 511 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 506 aa  167  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  32.37 
 
 		 503 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3231  AMP-dependent synthetase and ligase  26.16 
 
 		 534 aa  166  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000448213  normal  0.730696 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  23.95 
 
 		 585 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2778  putative long chain fatty-acid CoA ligase(long- chain acyl-CoA synthetase)  27.26 
 
 		 604 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422591  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1468  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.92 
 
 		 563 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  28.1 
 
 		 504 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3139  AMP-dependent synthetase and ligase  26.16 
 
 		 534 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000126557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  26.36 
 
 		 490 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  27.27 
 
 		 504 aa  165  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  32.05 
 
 		 501 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 492 aa  165  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  27.13 
 
 		 539 aa  165  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 569 aa  165  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  26.59 
 
 		 601 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.455088 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2322  AMP-dependent synthetase and ligase  26.54 
 
 		 523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000119755  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.84 
 
 		 563 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.83 
 
 		 524 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  28.09 
 
 		 500 aa  164  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.52 
 
 		 557 aa  164  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 553 aa  164  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  28.4 
 
 		 506 aa  163  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  28.28 
 
 		 504 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 504 aa  163  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  28.04 
 
 		 557 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  30.67 
 
 		 530 aa  163  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.13 
 
 		 566 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  25.82 
 
 		 534 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000227614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.69 
 
 		 560 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0200  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 		 566 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2897  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.82 
 
 		 531 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00596817  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  26.41 
 
 		 559 aa  161  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3695  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 		 534 aa  161  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  27.3 
 
 		 584 aa  162  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1720  AMP-dependent synthetase and ligase  27.05 
 
 		 586 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976205  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3775  AMP-dependent synthetase and ligase  26.06 
 
 		 564 aa  161  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  26.64 
 
 		 525 aa  161  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  26.96 
 
 		 506 aa  161  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 		 506 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.15 
 
 		 562 aa  160  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.15 
 
 		 562 aa  160  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>