More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0657 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  75 
 
 		 425 aa  639    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 452 aa  913    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  73.65 
 
 		 445 aa  638    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  71.43 
 
 		 442 aa  625  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  76.07 
 
 		 423 aa  622  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  72.24 
 
 		 434 aa  619  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  75.53 
 
 		 447 aa  609  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  72.88 
 
 		 420 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  72.38 
 
 		 432 aa  595  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  73.11 
 
 		 423 aa  595  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  70.45 
 
 		 427 aa  597  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  71.63 
 
 		 453 aa  594  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  72.81 
 
 		 422 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  71.43 
 
 		 435 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  70.6 
 
 		 435 aa  581  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  69.95 
 
 		 412 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  70.45 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  69.56 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  74.94 
 
 		 421 aa  576  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  70.62 
 
 		 432 aa  570  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  68.87 
 
 		 430 aa  566  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  67.85 
 
 		 430 aa  565  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  65.97 
 
 		 426 aa  560  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  69.5 
 
 		 422 aa  560  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  69.81 
 
 		 440 aa  557  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  68.32 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  69.77 
 
 		 434 aa  553  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  63.03 
 
 		 474 aa  524  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 424 aa  490  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  59.1 
 
 		 432 aa  491  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  58.55 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  57.27 
 
 		 430 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 		 413 aa  481  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  57.45 
 
 		 434 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  57.82 
 
 		 429 aa  482  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  57.82 
 
 		 418 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  57.45 
 
 		 434 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 434 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  57.92 
 
 		 440 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 431 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 		 425 aa  478  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  54.81 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  57.58 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 420 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  57.58 
 
 		 431 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  57.68 
 
 		 433 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  56.42 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  54.81 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 439 aa  478  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 438 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 438 aa  473  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  57.86 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  58.41 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  54.81 
 
 		 423 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  57.76 
 
 		 417 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  57.31 
 
 		 432 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  54.33 
 
 		 423 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  56.73 
 
 		 427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  56.29 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  56.94 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 		 411 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  55.98 
 
 		 415 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  56.25 
 
 		 415 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  57.27 
 
 		 433 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  53.57 
 
 		 416 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  55.87 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  56.01 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  56.65 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  55.42 
 
 		 422 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  53.15 
 
 		 423 aa  467  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 427 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  57.31 
 
 		 421 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 412 aa  464  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 413 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  53.21 
 
 		 427 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 414 aa  463  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  54.22 
 
 		 411 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  55.45 
 
 		 424 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  55.82 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 424 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3135  serine hydroxymethyltransferase  59.06 
 
 		 434 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  54.68 
 
 		 431 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  54.1 
 
 		 437 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 410 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  53.16 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  56.13 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.903187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>