More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0169 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  542  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.49 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.76 
 
 
282 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.76 
 
 
282 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.37 
 
 
276 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.54 
 
 
273 aa  255  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00507131  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 
250 aa  205  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
287 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38962  normal  0.0399907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
280 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1472  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  44.53 
 
 
282 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0273044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 
280 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
280 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
254 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
250 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
253 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
259 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
295 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
252 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
252 aa  165  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.15 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  41.86 
 
 
257 aa  161  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.11 
 
 
302 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  37.3 
 
 
251 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
244 aa  159  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
256 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
276 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
269 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 
280 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3076  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
285 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
251 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
247 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  38.85 
 
 
261 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 
263 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
247 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
263 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
260 aa  155  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
251 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.01 
 
 
255 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
263 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
248 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000355798  normal  0.0941785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 
290 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
264 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  42.8 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  38.98 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.82 
 
 
249 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
270 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.92 
 
 
249 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  39.37 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  39.37 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0727  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.31 
 
 
249 aa  152  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  37.79 
 
 
255 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  39.37 
 
 
258 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  38.98 
 
 
258 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
258 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 
257 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612868  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
277 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1429  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.04 
 
 
256 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.865814 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4948  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.58 
 
 
250 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
256 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
262 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  38.58 
 
 
258 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
264 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
253 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2147  sorbitol dehydrogenase  38.98 
 
 
256 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000207425  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
251 aa  150  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
245 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38 
 
 
249 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
263 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
262 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  38.19 
 
 
258 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  39.37 
 
 
258 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  38.19 
 
 
258 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  38.19 
 
 
258 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
260 aa  149  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35072  normal  0.362703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
248 aa  148  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  37.64 
 
 
258 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  37.64 
 
 
258 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  37.64 
 
 
258 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  37.64 
 
 
258 aa  148  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
246 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  37.21 
 
 
260 aa  148  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
262 aa  148  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
249 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.5 
 
 
250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  38.58 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.109818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>