54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0005 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  364  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  81.38 
 
 
188 aa  287  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  81.01 
 
 
190 aa  278  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  81.01 
 
 
190 aa  278  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  81.01 
 
 
190 aa  278  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  67.26 
 
 
187 aa  202  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  62.21 
 
 
180 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  67.11 
 
 
184 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  56.93 
 
 
166 aa  148  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  62.5 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  55.46 
 
 
173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  56 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  51.82 
 
 
217 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  51.94 
 
 
188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  42.95 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  48.15 
 
 
196 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  49.57 
 
 
185 aa  121  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  44.52 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  46.92 
 
 
134 aa  118  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  50.85 
 
 
187 aa  118  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  50.39 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  55.22 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  46.21 
 
 
196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  55.74 
 
 
201 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  45.32 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  45.08 
 
 
273 aa  107  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  44 
 
 
177 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  45.16 
 
 
207 aa  104  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  41.38 
 
 
266 aa  104  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  41.38 
 
 
164 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  43.33 
 
 
206 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  42.02 
 
 
183 aa  94  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  33.95 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  47.5 
 
 
171 aa  87.8  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  35.85 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  28.23 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  35.85 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  35.11 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  29.79 
 
 
151 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  29.79 
 
 
153 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  39.13 
 
 
152 aa  58.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  29.2 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  36.49 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  24.18 
 
 
97 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  25 
 
 
160 aa  48.5  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  29.17 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  27.63 
 
 
300 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  25.27 
 
 
97 aa  45.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0004  hypothetical protein  28.57 
 
 
97 aa  45.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2875  hypothetical protein  26.42 
 
 
162 aa  45.1  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0140441  hitchhiker  0.0000188483 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  29.59 
 
 
188 aa  45.1  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0004  protein of unknown function DUF721  28.57 
 
 
286 aa  42.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000131484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0004  protein of unknown function DUF721  30.11 
 
 
105 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  23.33 
 
 
102 aa  41.2  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>