153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0094 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0094  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
125 aa  254  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0425129  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2375  alkylhydroperoxidase-like protein  38.18 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.583402  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2454  hypothetical protein  39.29 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137937  normal  0.425603 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0261  alkylhydroperoxidase family protein  36.61 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3671  carboxymuconolactone decarboxylase  35.78 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1912  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.86 
 
 
115 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116994  hitchhiker  0.00092769 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.08 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2572  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.22 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.423134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01174  Alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 
115 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.767687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3718  putative carboxymuconolactone decarboxylase  37 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2368  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.05 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000359783  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0472  hypothetical protein  41.33 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0448  hypothetical protein  41.33 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.66 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1282  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.29 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  35.79 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  32.22 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  43.02 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0306  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.65 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.739579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1812  alkylhydroperoxidase  33.78 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0406  hypothetical protein  33.73 
 
 
125 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.73 
 
 
119 aa  58.2  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2753  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.87 
 
 
123 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.671955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  28.87 
 
 
123 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0078  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3926  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.18 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.14 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0351  carboxymuconolactone decarboxylase domain-containing protein  32 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  32.98 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1720  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.03 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.8171  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.84 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11795  hypothetical protein  30.39 
 
 
119 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000134545  hitchhiker  0.00000380763 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1190  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.37 
 
 
115 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.62 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4471  alkylhydroperoxidase  38.37 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0604  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.21 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  37.31 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  28.89 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0791  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.21 
 
 
211 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.11778  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0506  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.1 
 
 
203 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.57 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.653003  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1911  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.71 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  37.33 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1806  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.62 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1641  alkylhydroperoxidase  33.78 
 
 
120 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.306548 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  39.19 
 
 
116 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0006  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150055  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2853  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0620  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.79 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2476  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.52 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3036  alkylhydroperoxidase  29.27 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  31.11 
 
 
111 aa  50.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0431  carboxymuconolactone decarboxylase  28.16 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0121  hypothetical protein  27.93 
 
 
110 aa  50.4  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6230  alkylhydroperoxidase  27.66 
 
 
115 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534978  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0404  carboxymuconolactone decarboxylase  28.16 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482016  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1515  carboxymuconolactone decarboxylase  28.16 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  31.18 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.95 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  38.16 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.62 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2127  hypothetical protein  30.67 
 
 
268 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3628  alkylhydroperoxidase  28.74 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  30.59 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  32.05 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0657  carboxymuconolactone decarboxylase domain-containing protein  32.89 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.78 
 
 
111 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.82 
 
 
113 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0332  carboxymuconolactone decarboxylase  31.52 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.711458  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3075  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.41 
 
 
121 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0601  alkylhydroperoxidase  35.21 
 
 
108 aa  47  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123589  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  32.47 
 
 
117 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  34.33 
 
 
108 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  31.58 
 
 
112 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0615  alkylhydroperoxidase  35.21 
 
 
108 aa  47  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000257403  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0476  carboxymuconolactone decarboxylase  26.21 
 
 
104 aa  47  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.311058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  31.58 
 
 
112 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  34.33 
 
 
109 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4041  alkylhydroperoxidase  31.08 
 
 
116 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233548  normal  0.0297408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2644  hypothetical protein  31.33 
 
 
128 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0396958 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.33 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  35.11 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.33 
 
 
109 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  34.33 
 
 
109 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  34.33 
 
 
109 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  34.33 
 
 
109 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0181  carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437222  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  31.33 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  30.3 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0782  alkylhydroperoxidase  38.98 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.592163  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0163  carboxymuconolactone decarboxylase  30.21 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>