66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3667 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3667  major facilitator transporter  100 
 
 		 371 aa  672    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.331246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0467  major facilitator transporter  47.61 
 
 		 374 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.343035 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  32.54 
 
 		 390 aa  126  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  31.96 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  32.1 
 
 		 425 aa  99.8  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  31.52 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  28.09 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 408 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  28.96 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 406 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 409 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 419 aa  87  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  27.73 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  30.03 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 408 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  31.04 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 398 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  32.14 
 
 		 417 aa  67  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  27.33 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  26.18 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  26.74 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  26.73 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 423 aa  53.1  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  28.48 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  27.11 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  28.05 
 
 		 426 aa  49.7  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  35.98 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  26.09 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  25 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  34.78 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>