More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2612 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
407 aa  837    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
391 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
419 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
386 aa  143  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  31 
 
 
420 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 
414 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1382  glycosyltransferase-like protein  30.82 
 
 
387 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.702037  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.68 
 
 
411 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5787  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
415 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0364  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.39 
 
 
412 aa  113  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3374  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
408 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0766435  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1006  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
382 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3341  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 
426 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178171  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1818  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 
382 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
372 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  27.92 
 
 
437 aa  100  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6301  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
428 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
409 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6549  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
427 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
355 aa  90.1  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
409 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2879  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
385 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.658622  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  28.76 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  25.09 
 
 
404 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  29.65 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2971  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
391 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.176769  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
355 aa  86.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.31 
 
 
401 aa  86.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
904 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
384 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.44 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.93 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6548  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
539 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
406 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.19 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.59 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  33.59 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36.41 
 
 
775 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  25.66 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3577  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  29.24 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
410 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
820 aa  77  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 
371 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
467 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.61 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
810 aa  76.3  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  27.92 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  27.27 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
364 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0330  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0196896  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  23.88 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  26.25 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.23 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
816 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>