222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1844 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 279 aa  552  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  72.08 
 
 		 280 aa  384  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  56.88 
 
 		 284 aa  305  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  49.45 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  44.4 
 
 		 270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  42.8 
 
 		 270 aa  229  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  41.38 
 
 		 303 aa  228  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  41.38 
 
 		 303 aa  228  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  41.7 
 
 		 281 aa  228  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  43.31 
 
 		 283 aa  228  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  45.42 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  49.06 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  42.34 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  43.63 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  41.64 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  41.4 
 
 		 295 aa  219  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  43.24 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  40.71 
 
 		 282 aa  218  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  41.82 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  40.56 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  45.56 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  43.17 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  40.54 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  42.86 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  42.35 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  42.35 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  43.85 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  42.47 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  43.07 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  39.05 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0716  formate/nitrite transporter  45.77 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.991345  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7925  formate/nitrite transporter  45.56 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295053  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  40.89 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  39.05 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  41.75 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0730  formate/nitrite transporter  45.77 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.0144378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  43.27 
 
 		 289 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0710  formate/nitrite transporter  45.17 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  41.42 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2657  formate and nitrite transporters  40.77 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00842969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  40.91 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2747  formate/nitrite transporter  40.54 
 
 		 282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147649  normal  0.259704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  38.49 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  38.41 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0836  formate/nitrite transporter  43.93 
 
 		 274 aa  185  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0109  formate/nitrite transporter  38.91 
 
 		 306 aa  185  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  39.93 
 
 		 275 aa  185  8e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  38.04 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  37.32 
 
 		 274 aa  176  6e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3094  formate/nitrite transporter  39.52 
 
 		 296 aa  175  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.853793  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1071  formate/nitrite transporter  38.76 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3006  formate/nitrite transporter  37.98 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  33.79 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  32.54 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  33.21 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  33.92 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  33.68 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  33.09 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  32.85 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  33.79 
 
 		 271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  32.85 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  32.85 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  32.73 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  32.03 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  32.85 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  32.85 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  32.6 
 
 		 270 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  32.87 
 
 		 271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  33.93 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  35.09 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  34.32 
 
 		 269 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  35 
 
 		 323 aa  126  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  31.39 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  30.46 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  30.84 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  30.42 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  29.76 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  27.62 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  31.29 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  29.56 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  29.56 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  33.04 
 
 		 251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  29.96 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  31.25 
 
 		 310 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  28.98 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  28.68 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  27.94 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  28.68 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  27.94 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  27.94 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  30.53 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  30.53 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  27.94 
 
 		 259 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  27.57 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  31.87 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  29.47 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  31.62 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  29.47 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  29.47 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>