More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1631 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1631  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 373 aa  752    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00422743  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1320  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.67 
 
 		 358 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0676777  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1259  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.66 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1564  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.87 
 
 		 379 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0893  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.04 
 
 		 383 aa  275  6e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0543  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.77 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00293092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1707  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.62 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.17802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0110  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.81 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228943  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0204  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.64 
 
 		 379 aa  269  5e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0048  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.94 
 
 		 383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1509  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.1 
 
 		 400 aa  262  8e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00480326  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0462  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.74 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1878  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.19 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115823 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0870  signal recognition particle-docking protein FtsY  47 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1965  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.03 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3022  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.77 
 
 		 353 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1475  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.75 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.487639  decreased coverage  0.0000361421 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0396  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.62 
 
 		 513 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0574557 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0239  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.45 
 
 		 529 aa  241  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1229  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.3 
 
 		 367 aa  239  5.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.77749  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1829  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.76 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.704875 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1605  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.2 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1815  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.21 
 
 		 470 aa  236  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1328  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.3 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1659  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.17 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0821  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.75 
 
 		 371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0461  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.56 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  38.23 
 
 		 541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.94 
 
 		 510 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.68 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.34 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  39.29 
 
 		 505 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  40 
 
 		 494 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  40 
 
 		 497 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.94 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0429  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.58 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.34 
 
 		 514 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  41.73 
 
 		 362 aa  206  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.09 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.34 
 
 		 513 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.95 
 
 		 452 aa  202  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.53 
 
 		 453 aa  202  7e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.85 
 
 		 485 aa  202  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  41.75 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  37.65 
 
 		 563 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.41 
 
 		 535 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.89 
 
 		 432 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  41.61 
 
 		 495 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.11 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  38.1 
 
 		 498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.1 
 
 		 497 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  38.1 
 
 		 498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  38.1 
 
 		 498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  38.1 
 
 		 498 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  38.1 
 
 		 498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.87 
 
 		 481 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  39.09 
 
 		 512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  38.02 
 
 		 497 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119580  predicted protein  33.33 
 
 		 525 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00236859  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.04 
 
 		 397 aa  196  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.13 
 
 		 302 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  38.92 
 
 		 497 aa  195  9e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.41 
 
 		 523 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.63 
 
 		 515 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.81 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  41.41 
 
 		 553 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  37.65 
 
 		 491 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  41.41 
 
 		 541 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  38.1 
 
 		 491 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.67 
 
 		 540 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.07 
 
 		 501 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1312  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.42 
 
 		 288 aa  194  3e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.302552  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.38 
 
 		 561 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  42.01 
 
 		 451 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  38.39 
 
 		 511 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  40.2 
 
 		 491 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  40.2 
 
 		 491 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0632  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.05 
 
 		 410 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  42.01 
 
 		 447 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.38 
 
 		 491 aa  192  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.17 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.42 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.99 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0619  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.44 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124261  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.77 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1843  Signal recognition particle-docking protein FtsY  38.63 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1395  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.33 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0843  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  38.91 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.85 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.26 
 
 		 447 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4170  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.95 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.38 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  39.86 
 
 		 491 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  36.13 
 
 		 510 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  40.74 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1544  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.66 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.19 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  40.4 
 
 		 407 aa  190  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3847  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.7 
 
 		 584 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00993758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.86 
 
 		 478 aa  189  5e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>