More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1328 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1328  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 
394 aa  772    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1229  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.46 
 
 
367 aa  495  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.77749  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1815  signal recognition particle-docking protein FtsY  73.1 
 
 
470 aa  440  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0239  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.41 
 
 
529 aa  430  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0821  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.74 
 
 
371 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1564  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.11 
 
 
379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0110  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.07 
 
 
366 aa  333  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0462  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.92 
 
 
422 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1965  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.53 
 
 
354 aa  292  6e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0543  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.1 
 
 
409 aa  291  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00293092  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1878  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.17 
 
 
344 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.115823 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3022  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.17 
 
 
353 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1475  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.83 
 
 
337 aa  281  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.487639  decreased coverage  0.0000361421 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1259  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.91 
 
 
307 aa  263  3e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1631  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.6 
 
 
373 aa  242  7.999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00422743  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1707  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.35 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.17802  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0893  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.06 
 
 
383 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0204  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.35 
 
 
379 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1509  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.47 
 
 
400 aa  228  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00480326  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0048  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.84 
 
 
383 aa  224  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1320  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.01 
 
 
358 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0676777  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0396  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.99 
 
 
513 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0574557 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0870  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.52 
 
 
302 aa  212  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0429  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.86 
 
 
302 aa  196  9e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1605  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.86 
 
 
305 aa  193  4e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.02 
 
 
373 aa  192  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1829  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.86 
 
 
305 aa  191  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.704875 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  37.19 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  36.65 
 
 
485 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  37.54 
 
 
457 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000642448  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.59 
 
 
447 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.86 
 
 
514 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  36.84 
 
 
457 aa  182  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.32 
 
 
375 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.52 
 
 
497 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0461  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.43 
 
 
307 aa  182  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.52 
 
 
494 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1659  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.07 
 
 
305 aa  182  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.52 
 
 
510 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  36.84 
 
 
457 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  36.49 
 
 
457 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  36.49 
 
 
457 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  37.01 
 
 
495 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  35.94 
 
 
453 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  38.6 
 
 
362 aa  179  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3368  signal recognition particle protein  36.49 
 
 
457 aa  179  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  35.23 
 
 
453 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  35.94 
 
 
453 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  35.94 
 
 
453 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  36.14 
 
 
453 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  35.94 
 
 
453 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  35.94 
 
 
453 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  35.94 
 
 
453 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  35.94 
 
 
453 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  35.94 
 
 
453 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  35.94 
 
 
453 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  35.94 
 
 
453 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  35.94 
 
 
453 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  35.94 
 
 
453 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  35.94 
 
 
453 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  35.94 
 
 
453 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.14 
 
 
405 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  35.94 
 
 
453 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.93 
 
 
340 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.96 
 
 
312 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  37.14 
 
 
518 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  36.81 
 
 
350 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.3 
 
 
329 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14212  predicted protein  35.79 
 
 
308 aa  176  9e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0513448  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  46.77 
 
 
671 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  34.88 
 
 
453 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.31 
 
 
329 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  34.98 
 
 
453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0382  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.93 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0029967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.38 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0936  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.24 
 
 
397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.3 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  35.59 
 
 
478 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  35 
 
 
448 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.54 
 
 
329 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1209  signal recognition particle protein  36.49 
 
 
457 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000238593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3104  signal recognition particle protein  36.49 
 
 
457 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000441877  normal  0.0737294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.78 
 
 
501 aa  172  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3017  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.59 
 
 
474 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0662869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.3 
 
 
302 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.92 
 
 
329 aa  172  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.92 
 
 
329 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.54 
 
 
329 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.16 
 
 
329 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.16 
 
 
329 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  39.16 
 
 
329 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.92 
 
 
447 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.72 
 
 
351 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.16 
 
 
329 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  37.01 
 
 
458 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.1 
 
 
456 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  35.79 
 
 
453 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1253  signal recognition particle protein  36.49 
 
 
457 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000179157  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  39.16 
 
 
329 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.11 
 
 
335 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>