More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1815 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1815  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 470 aa  920    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0239  signal recognition particle-docking protein FtsY  89.86 
 
 		 529 aa  548  1e-155  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1328  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.58 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1229  signal recognition particle-docking protein FtsY  73.63 
 
 		 367 aa  439  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.77749  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0821  signal recognition particle-docking protein FtsY  75.52 
 
 		 371 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1564  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.31 
 
 		 379 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0110  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.97 
 
 		 366 aa  346  5e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0462  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.9 
 
 		 422 aa  338  8e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0543  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.73 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00293092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1965  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.08 
 
 		 354 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1475  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.7 
 
 		 337 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.487639  decreased coverage  0.0000361421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3022  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.74 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1878  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.72 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115823 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1707  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.71 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.17802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1259  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.55 
 
 		 307 aa  266  5e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0893  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.48 
 
 		 383 aa  259  7e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0204  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.48 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1509  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.25 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00480326  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0048  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.04 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0396  signal recognition particle-docking protein FtsY  42 
 
 		 513 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0574557 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1631  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.21 
 
 		 373 aa  236  7e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00422743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0870  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.86 
 
 		 302 aa  225  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1320  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.27 
 
 		 358 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1605  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.02 
 
 		 305 aa  207  4e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1829  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.93 
 
 		 305 aa  196  7e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.704875 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1659  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.11 
 
 		 305 aa  192  8e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.35 
 
 		 312 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0429  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.43 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  35.76 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  35.76 
 
 		 457 aa  191  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.17 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  36.3 
 
 		 495 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  35.56 
 
 		 485 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  35.69 
 
 		 453 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  34.63 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  34.72 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.86 
 
 		 456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  35.07 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000642448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  34.98 
 
 		 448 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0461  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.71 
 
 		 307 aa  184  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  35.92 
 
 		 478 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3017  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.57 
 
 		 474 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0662869  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.98 
 
 		 302 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3104  signal recognition particle protein  36.04 
 
 		 457 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000441877  normal  0.0737294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1209  signal recognition particle protein  36.04 
 
 		 457 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000238593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3771  signal recognition particle protein  34.98 
 
 		 460 aa  183  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000572875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.87 
 
 		 373 aa  182  8.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  34.63 
 
 		 457 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  36.4 
 
 		 449 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1253  signal recognition particle protein  36.04 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000179157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  37.97 
 
 		 362 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0181  signal recognition particle protein  37.1 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.9 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  37.46 
 
 		 446 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1286  signal recognition particle protein  36.04 
 
 		 457 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000571618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.24 
 
 		 301 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  33.22 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.83 
 
 		 329 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2839  signal recognition particle protein  35.69 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000124707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2921  signal recognition particle protein  36.04 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000450795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3018  signal recognition particle protein  35.69 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000039159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0382  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.05 
 
 		 304 aa  180  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0029967  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.7 
 
 		 302 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  33.92 
 
 		 453 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  33.92 
 
 		 453 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  33.92 
 
 		 453 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  33.57 
 
 		 453 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  33.92 
 
 		 453 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  33.92 
 
 		 453 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  35.34 
 
 		 448 aa  180  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  33.22 
 
 		 453 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  35.34 
 
 		 457 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.83 
 
 		 329 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  33.57 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  33.57 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  33.57 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  33.57 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  33.57 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  33.57 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  33.57 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1167  signal recognition particle protein  35.69 
 
 		 457 aa  179  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000256544  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  33.57 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3368  signal recognition particle protein  34.63 
 
 		 457 aa  179  8e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  33.22 
 
 		 453 aa  179  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  33.22 
 
 		 453 aa  179  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1404  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.66 
 
 		 491 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294047  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0426  signal recognition particle protein  34.98 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.56 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  33.57 
 
 		 439 aa  178  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  37.59 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  33.22 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.45 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.45 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.03 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  33.33 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  32.86 
 
 		 463 aa  177  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  35.54 
 
 		 450 aa  176  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  34.58 
 
 		 459 aa  176  7e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>