More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0239 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0239  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 
529 aa  1014    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1815  signal recognition particle-docking protein FtsY  83.38 
 
 
470 aa  552  1e-156  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1229  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.95 
 
 
367 aa  437  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.77749  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0821  signal recognition particle-docking protein FtsY  73.79 
 
 
371 aa  433  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1328  signal recognition particle-docking protein FtsY  70.49 
 
 
394 aa  420  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1564  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.42 
 
 
379 aa  362  1e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0110  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.14 
 
 
366 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0462  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.63 
 
 
422 aa  347  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1965  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.74 
 
 
354 aa  327  5e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1475  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.49 
 
 
337 aa  320  3e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.487639  decreased coverage  0.0000361421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0543  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.68 
 
 
409 aa  318  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00293092  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3022  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.41 
 
 
353 aa  302  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1878  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.04 
 
 
344 aa  299  7e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.115823 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1259  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.4 
 
 
307 aa  282  1e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1707  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.63 
 
 
383 aa  267  4e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.17802  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1509  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.55 
 
 
400 aa  262  1e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00480326  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0893  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.76 
 
 
383 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0204  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.1 
 
 
379 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0048  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.28 
 
 
383 aa  252  1e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1631  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.45 
 
 
373 aa  241  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00422743  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0396  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.67 
 
 
513 aa  240  5e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0574557 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0870  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.29 
 
 
302 aa  229  7e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1320  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.99 
 
 
358 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1605  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.79 
 
 
305 aa  206  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  39.46 
 
 
362 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0429  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.44 
 
 
302 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1829  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.29 
 
 
305 aa  197  6e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.704875 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.38 
 
 
373 aa  196  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.49 
 
 
312 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0382  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.93 
 
 
304 aa  194  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0029967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  37.02 
 
 
457 aa  193  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  37.02 
 
 
457 aa  193  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1209  signal recognition particle protein  37.72 
 
 
457 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000238593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  37.02 
 
 
457 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000642448  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1253  signal recognition particle protein  38.14 
 
 
457 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000179157  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1659  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.6 
 
 
305 aa  191  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  37.54 
 
 
485 aa  192  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3104  signal recognition particle protein  37.72 
 
 
457 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000441877  normal  0.0737294 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.61 
 
 
301 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1286  signal recognition particle protein  38.14 
 
 
457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000571618  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  36.33 
 
 
453 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  36.33 
 
 
453 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  36.33 
 
 
453 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  36.33 
 
 
453 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.81 
 
 
456 aa  191  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  36.33 
 
 
453 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  36.55 
 
 
457 aa  191  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.75 
 
 
351 aa  190  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  36.55 
 
 
457 aa  190  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  35.99 
 
 
453 aa  189  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  35.64 
 
 
453 aa  189  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  35.99 
 
 
453 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  35.99 
 
 
453 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  35.99 
 
 
453 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  35.99 
 
 
453 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.55 
 
 
340 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  35.99 
 
 
453 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  35.99 
 
 
453 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  35.99 
 
 
453 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  35.99 
 
 
453 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  35.29 
 
 
453 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  36.68 
 
 
457 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  35.64 
 
 
453 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  30.9 
 
 
494 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  35.29 
 
 
453 aa  187  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.85 
 
 
329 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4170  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.06 
 
 
313 aa  187  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3718  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.85 
 
 
361 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  36.24 
 
 
350 aa  186  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  35.59 
 
 
505 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.85 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.93 
 
 
510 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3771  signal recognition particle protein  36.04 
 
 
460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000572875  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.56 
 
 
302 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.85 
 
 
329 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.92 
 
 
513 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.22 
 
 
497 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.19 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  36.97 
 
 
495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.66 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  35.91 
 
 
478 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.5 
 
 
335 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.59 
 
 
295 aa  184  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  35.71 
 
 
439 aa  184  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3368  signal recognition particle protein  36.27 
 
 
457 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  35.29 
 
 
453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.27 
 
 
329 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  36.26 
 
 
355 aa  184  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2839  signal recognition particle protein  36.68 
 
 
457 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000124707  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2921  signal recognition particle protein  37.02 
 
 
457 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000450795  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3018  signal recognition particle protein  36.68 
 
 
457 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000039159  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1167  signal recognition particle protein  37.11 
 
 
457 aa  183  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000256544  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  36.75 
 
 
448 aa  183  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.46 
 
 
329 aa  183  7e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0461  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.37 
 
 
307 aa  183  7e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  36.33 
 
 
457 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.61 
 
 
501 aa  182  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  36.49 
 
 
458 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  36.21 
 
 
453 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.11 
 
 
329 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>