More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0396 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0396  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 513 aa  1005    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0574557 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0204  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.5 
 
 		 379 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0110  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.67 
 
 		 366 aa  267  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228943  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0893  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.17 
 
 		 383 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1259  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.54 
 
 		 307 aa  260  5.0000000000000005e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1564  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.29 
 
 		 379 aa  258  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1707  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.64 
 
 		 383 aa  257  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.17802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1475  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.98 
 
 		 337 aa  256  9e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.487639  decreased coverage  0.0000361421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0462  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.84 
 
 		 422 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1320  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.61 
 
 		 358 aa  251  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0048  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.35 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1509  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.47 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00480326  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1631  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.93 
 
 		 373 aa  246  6.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00422743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0239  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.99 
 
 		 529 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1815  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.3 
 
 		 470 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1965  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.88 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0429  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.3 
 
 		 302 aa  238  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1878  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.6 
 
 		 344 aa  237  5.0000000000000005e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115823 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0821  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.64 
 
 		 371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3022  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.52 
 
 		 353 aa  229  8e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1229  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.04 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.77749  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1605  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.59 
 
 		 305 aa  227  4e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0870  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.72 
 
 		 302 aa  226  6e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1829  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.43 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.704875 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0543  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.31 
 
 		 409 aa  224  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00293092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119580  predicted protein  38.59 
 
 		 525 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00236859  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1659  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.43 
 
 		 305 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0461  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.43 
 
 		 307 aa  203  6e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1328  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.25 
 
 		 394 aa  202  8e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.41 
 
 		 329 aa  190  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03050  signal recognition particle binding protein, putative  34.15 
 
 		 674 aa  189  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.36 
 
 		 329 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.36 
 
 		 329 aa  187  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.59 
 
 		 456 aa  186  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.46 
 
 		 329 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  34.6 
 
 		 505 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.63 
 
 		 329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.27 
 
 		 512 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.6 
 
 		 513 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.1 
 
 		 329 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06627  signal sequence receptor alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03850)  36.61 
 
 		 636 aa  182  9.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.771052  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  36.63 
 
 		 329 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.12 
 
 		 510 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.44 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.44 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.26 
 
 		 329 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  36.26 
 
 		 329 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.26 
 
 		 329 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.26 
 
 		 329 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  40.53 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  35.47 
 
 		 446 aa  179  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.46 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.5 
 
 		 405 aa  179  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0619  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.09 
 
 		 347 aa  177  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124261  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.44 
 
 		 514 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.6 
 
 		 373 aa  176  8e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.22 
 
 		 329 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  35.25 
 
 		 518 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1157  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.59 
 
 		 508 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000684917  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  34.58 
 
 		 512 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.38 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.38 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3017  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.18 
 
 		 474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0662869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0277  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.01 
 
 		 546 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1382  signal recognition particle protein  34.92 
 
 		 489 aa  174  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1340  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.11 
 
 		 288 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.903625  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1221  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.11 
 
 		 288 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14471  signal recognition particle protein (SRP54)  34.58 
 
 		 492 aa  173  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1371  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.59 
 
 		 306 aa  172  9e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414479  normal  0.531807 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  35.23 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  38.01 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1588  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.99 
 
 		 518 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0426  signal recognition particle protein  33.03 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0075  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.35 
 
 		 297 aa  172  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.92 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2324  signal recognition particle-docking protein FtsY  30.7 
 
 		 606 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0944454  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  39.51 
 
 		 498 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.1 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  32 
 
 		 433 aa  172  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  39.51 
 
 		 498 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  39.51 
 
 		 497 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  31.71 
 
 		 433 aa  172  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.07 
 
 		 326 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  39.51 
 
 		 498 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.01 
 
 		 497 aa  171  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1976  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.35 
 
 		 328 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  39.51 
 
 		 498 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.33 
 
 		 312 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.07 
 
 		 501 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.65 
 
 		 347 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  39.51 
 
 		 498 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.09 
 
 		 302 aa  171  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3223  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.19 
 
 		 483 aa  170  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  38.77 
 
 		 491 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  38.33 
 
 		 511 aa  170  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0455  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.64 
 
 		 382 aa  170  7e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000410251  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  38.77 
 
 		 491 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  39.51 
 
 		 491 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.92 
 
 		 454 aa  169  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  38.77 
 
 		 491 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>