More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1564 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1564  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 379 aa  759    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0110  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.29 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0462  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.56 
 
 		 422 aa  419  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1965  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.13 
 
 		 354 aa  363  2e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0239  signal recognition particle-docking protein FtsY  60.42 
 
 		 529 aa  356  5e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1815  signal recognition particle-docking protein FtsY  59.31 
 
 		 470 aa  352  7e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1878  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.15 
 
 		 344 aa  346  3e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115823 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3022  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 		 353 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1259  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.99 
 
 		 307 aa  338  9.999999999999999e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1475  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.61 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.487639  decreased coverage  0.0000361421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0543  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.48 
 
 		 409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00293092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0821  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.87 
 
 		 371 aa  333  2e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1229  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.42 
 
 		 367 aa  328  7e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.77749  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1328  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.11 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1707  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.31 
 
 		 383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.17802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0204  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.46 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0893  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.19 
 
 		 383 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1509  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.09 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00480326  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0048  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.44 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1631  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.1 
 
 		 373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00422743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0396  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.29 
 
 		 513 aa  259  6e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0574557 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1320  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.77 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0870  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.46 
 
 		 302 aa  252  9.000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1829  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.91 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.704875 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1605  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.91 
 
 		 305 aa  232  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0461  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.16 
 
 		 307 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1659  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.84 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0429  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.12 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.59 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.53 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  42.96 
 
 		 671 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.91 
 
 		 347 aa  196  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  35 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  41.24 
 
 		 541 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  40.07 
 
 		 457 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.47 
 
 		 342 aa  193  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.23 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.09 
 
 		 561 aa  192  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.63 
 
 		 643 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3771  signal recognition particle protein  39.21 
 
 		 460 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000572875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0444  signal recognition particle protein  38.16 
 
 		 468 aa  189  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  38.55 
 
 		 505 aa  189  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.66 
 
 		 320 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  51.83 
 
 		 497 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.95 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  51.83 
 
 		 498 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.83 
 
 		 497 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  37.58 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.2 
 
 		 510 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  51.83 
 
 		 498 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  37.8 
 
 		 453 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  51.83 
 
 		 498 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.15 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  51.83 
 
 		 498 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  38.87 
 
 		 457 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0199  signal recognition particle protein  39.57 
 
 		 449 aa  188  2e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.22 
 
 		 377 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.06 
 
 		 302 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  51.83 
 
 		 498 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  51.83 
 
 		 512 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.78 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.95 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  51.31 
 
 		 491 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4164  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.83 
 
 		 611 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00648424  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  43.35 
 
 		 410 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  48.95 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.51 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.13 
 
 		 456 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  38.65 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.95 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.66 
 
 		 513 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  51.31 
 
 		 511 aa  187  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.07 
 
 		 478 aa  186  4e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0171  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.83 
 
 		 621 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116132  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  51.83 
 
 		 491 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.95 
 
 		 329 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  51.83 
 
 		 491 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  51.83 
 
 		 491 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.95 
 
 		 329 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.72 
 
 		 397 aa  186  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  51.83 
 
 		 491 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  43.68 
 
 		 471 aa  186  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.69 
 
 		 514 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  49 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.42 
 
 		 477 aa  186  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1976  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.53 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4094  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.83 
 
 		 615 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000394743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4295  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.83 
 
 		 540 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00341336  normal  0.0288649 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  44.21 
 
 		 407 aa  186  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.36 
 
 		 494 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  38.3 
 
 		 453 aa  186  8e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  41.13 
 
 		 362 aa  186  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3718  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.26 
 
 		 361 aa  185  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.78 
 
 		 302 aa  185  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.95 
 
 		 329 aa  185  9e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.89 
 
 		 482 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.42 
 
 		 329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  37.77 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  51.83 
 
 		 497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  37.77 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>