More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1878 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1878  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 344 aa  679    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115823 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1965  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.33 
 
 		 354 aa  475  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0543  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.68 
 
 		 409 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00293092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3022  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.18 
 
 		 353 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1475  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.42 
 
 		 337 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.487639  decreased coverage  0.0000361421 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1564  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.41 
 
 		 379 aa  355  8.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0110  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.95 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0462  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.33 
 
 		 422 aa  330  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0239  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.08 
 
 		 529 aa  296  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1229  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.86 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.77749  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1259  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.83 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1815  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.72 
 
 		 470 aa  280  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0821  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.18 
 
 		 371 aa  279  5e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1328  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.9 
 
 		 394 aa  271  8.000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1707  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.27 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.17802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1631  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.44 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00422743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0893  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.73 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0048  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.1 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0204  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.46 
 
 		 379 aa  248  8e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0396  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.6 
 
 		 513 aa  238  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0574557 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1509  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.96 
 
 		 400 aa  237  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00480326  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1320  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.93 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0870  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.91 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1605  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.35 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1829  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.14 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.704875 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.14 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0429  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.49 
 
 		 302 aa  192  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.85 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.57 
 
 		 295 aa  186  7e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2724  hypothetical protein  39.85 
 
 		 355 aa  185  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2597  hypothetical protein  39.46 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  35.67 
 
 		 350 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.15 
 
 		 351 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1659  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.01 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.47 
 
 		 342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119580  predicted protein  34.1 
 
 		 525 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00236859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.69 
 
 		 513 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  37.98 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.54 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.69 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  38.69 
 
 		 505 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  36.86 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0461  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.5 
 
 		 307 aa  180  4e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.69 
 
 		 494 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.62 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.28 
 
 		 317 aa  179  9e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.69 
 
 		 497 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.42 
 
 		 320 aa  178  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4170  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.01 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.69 
 
 		 514 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.16 
 
 		 475 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.18 
 
 		 510 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.43 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.67 
 
 		 452 aa  176  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  38.24 
 
 		 671 aa  175  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  35.8 
 
 		 495 aa  175  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  36.51 
 
 		 471 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.33 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  39.31 
 
 		 491 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01431  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.36 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15526  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  39.31 
 
 		 491 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  39.31 
 
 		 491 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  39.31 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  39.31 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5354  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.99 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.83 
 
 		 432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.96 
 
 		 501 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.99 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2354  cell division membrane protein  44.28 
 
 		 472 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000763762  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  38.93 
 
 		 511 aa  172  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  38.17 
 
 		 497 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.32 
 
 		 453 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  38.17 
 
 		 498 aa  172  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.85 
 
 		 329 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  38.17 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.17 
 
 		 497 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.74 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.26 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.21 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.85 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  38.17 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  38.17 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  38.02 
 
 		 512 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  38.17 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.42 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.86 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0402  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.63 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.797523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  35.56 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.21 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0317  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.46 
 
 		 483 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.21 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  44.21 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.49 
 
 		 451 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.97 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.26 
 
 		 485 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.64 
 
 		 447 aa  170  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  33.7 
 
 		 444 aa  170  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.21 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.16 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0843  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  34.74 
 
 		 292 aa  170  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>