More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0821 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0821  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 371 aa  733    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1229  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.3 
 
 		 367 aa  455  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.77749  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1815  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.87 
 
 		 470 aa  456  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0239  signal recognition particle-docking protein FtsY  73.79 
 
 		 529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1328  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.54 
 
 		 394 aa  426  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1564  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.65 
 
 		 379 aa  361  1e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0110  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.6 
 
 		 366 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0462  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.98 
 
 		 422 aa  341  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1965  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.24 
 
 		 354 aa  328  6e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3022  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.97 
 
 		 353 aa  309  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1475  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.65 
 
 		 337 aa  295  1e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.487639  decreased coverage  0.0000361421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0543  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.63 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00293092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1878  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.69 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115823 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1259  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.2 
 
 		 307 aa  276  6e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1707  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.48 
 
 		 383 aa  249  4e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.17802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0893  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.88 
 
 		 383 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0204  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.37 
 
 		 379 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1509  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.04 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00480326  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0396  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.2 
 
 		 513 aa  241  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0574557 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1631  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.07 
 
 		 373 aa  238  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00422743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0048  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.84 
 
 		 383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1320  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.21 
 
 		 358 aa  220  3e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0870  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.37 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1605  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.65 
 
 		 305 aa  207  3e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1829  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.77 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.704875 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1659  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.93 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.42 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  39.15 
 
 		 453 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0429  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.93 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.1 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.02 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0461  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.08 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  37.41 
 
 		 457 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000196553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.81 
 
 		 329 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5337  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.08 
 
 		 515 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0181  signal recognition particle protein  38.16 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4170  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.29 
 
 		 313 aa  183  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  37.1 
 
 		 485 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.14 
 
 		 513 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  38.14 
 
 		 505 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.06 
 
 		 329 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  36.71 
 
 		 457 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.11 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.69 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  37.69 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.69 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.69 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.06 
 
 		 329 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  37.06 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000142989  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.83 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.9 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.06 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.06 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  37.06 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000049947  hitchhiker  0.0000752283 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.04 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.11 
 
 		 497 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.46 
 
 		 514 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  35.52 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  37.69 
 
 		 329 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  37.5 
 
 		 458 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  37.72 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  37.5 
 
 		 458 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  37.41 
 
 		 495 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  35.46 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  35.46 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.11 
 
 		 510 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.11 
 
 		 494 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1371  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.21 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414479  normal  0.531807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  36.4 
 
 		 478 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  39.11 
 
 		 451 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.78 
 
 		 454 aa  179  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3771  signal recognition particle protein  35.94 
 
 		 460 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000572875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.94 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.97 
 
 		 376 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  38.75 
 
 		 447 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.26 
 
 		 302 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  34.52 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  34.8 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  34.8 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  34.8 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  34.8 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  35.96 
 
 		 457 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000642448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  34.8 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  34.9 
 
 		 463 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0936  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.31 
 
 		 397 aa  176  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.17 
 
 		 451 aa  176  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.73 
 
 		 335 aa  176  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.34 
 
 		 340 aa  176  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.52 
 
 		 551 aa  176  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3451  signal recognition particle protein  38.8 
 
 		 568 aa  176  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0611736 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  32.54 
 
 		 433 aa  176  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2839  signal recognition particle protein  35.52 
 
 		 457 aa  176  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000124707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2921  signal recognition particle protein  35.86 
 
 		 457 aa  176  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000450795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3018  signal recognition particle protein  35.52 
 
 		 457 aa  176  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000039159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  33.94 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  34.75 
 
 		 463 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3368  signal recognition particle protein  36.82 
 
 		 550 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  36.14 
 
 		 518 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3104  signal recognition particle protein  35.52 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000441877  normal  0.0737294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1253  signal recognition particle protein  35.52 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000179157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>