More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0204 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0204  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 
379 aa  749    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1707  signal recognition particle-docking protein FtsY  89.03 
 
 
383 aa  645    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.17802  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0893  signal recognition particle-docking protein FtsY  92.43 
 
 
383 aa  675    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1509  signal recognition particle-docking protein FtsY  75.31 
 
 
400 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00480326  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0048  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.24 
 
 
383 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0110  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.91 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228943  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1564  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.46 
 
 
379 aa  325  9e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1259  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.9 
 
 
307 aa  316  3e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0462  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.29 
 
 
422 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1475  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.63 
 
 
337 aa  286  5e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.487639  decreased coverage  0.0000361421 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1631  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.64 
 
 
373 aa  282  7.000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00422743  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1320  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.64 
 
 
358 aa  281  1e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0676777  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0396  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.34 
 
 
513 aa  279  6e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0574557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3022  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.58 
 
 
353 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0543  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.16 
 
 
409 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00293092  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1815  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.48 
 
 
470 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1965  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.65 
 
 
354 aa  271  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0239  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.62 
 
 
529 aa  270  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1878  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.46 
 
 
344 aa  259  6e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.115823 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0821  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.05 
 
 
371 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1229  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.21 
 
 
367 aa  245  8e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.77749  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1829  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.76 
 
 
305 aa  238  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.704875 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0870  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.01 
 
 
302 aa  237  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1605  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.93 
 
 
305 aa  233  3e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1328  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.97 
 
 
394 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0429  signal recognition particle-docking protein FtsY  41 
 
 
302 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0461  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.35 
 
 
307 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.43 
 
 
373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1659  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.49 
 
 
305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.5 
 
 
452 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.67 
 
 
494 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.61 
 
 
510 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.84 
 
 
497 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.64 
 
 
453 aa  206  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.77 
 
 
514 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  39.94 
 
 
541 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  39.56 
 
 
471 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.44 
 
 
513 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  38.44 
 
 
505 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  37.42 
 
 
362 aa  203  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  39.56 
 
 
495 aa  202  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.48 
 
 
405 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.94 
 
 
347 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.88 
 
 
432 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.32 
 
 
497 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1371  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.03 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414479  normal  0.531807 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  42.6 
 
 
512 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  42.6 
 
 
498 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  42.6 
 
 
498 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  42.6 
 
 
498 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  42.6 
 
 
498 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  40 
 
 
501 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  42.6 
 
 
498 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2988  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.44 
 
 
329 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.289168  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  42.24 
 
 
497 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.38 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0133  cytochrome oxidase assembly family protein/cell division protein FtsY  39.86 
 
 
671 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.65 
 
 
535 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.24 
 
 
485 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  43.64 
 
 
511 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  42.6 
 
 
497 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  42.65 
 
 
541 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  42.65 
 
 
553 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.65 
 
 
523 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2374  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.7 
 
 
387 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000224512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.64 
 
 
329 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.73 
 
 
413 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.6 
 
 
375 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.85 
 
 
310 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  43.91 
 
 
410 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.7 
 
 
451 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  42.96 
 
 
407 aa  193  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.66 
 
 
329 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.37 
 
 
561 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1544  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.04 
 
 
391 aa  192  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  42.18 
 
 
491 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  42.55 
 
 
491 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  42.55 
 
 
491 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  42.55 
 
 
491 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  42.55 
 
 
491 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.72 
 
 
335 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0219  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.78 
 
 
540 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1976  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.64 
 
 
328 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.64 
 
 
329 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0376  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.71 
 
 
376 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207178  decreased coverage  0.0031492 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.71 
 
 
329 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0468  signal recognition particle receptor FtsY  41.97 
 
 
447 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.8 
 
 
643 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04900  signal recognition particle receptor FtsY  42.12 
 
 
451 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653255  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  48 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03050  signal recognition particle binding protein, putative  35 
 
 
674 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.38 
 
 
397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.27 
 
 
329 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4175  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.91 
 
 
475 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0143973  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0056  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.29 
 
 
354 aa  190  4e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.377347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.64 
 
 
329 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  39.64 
 
 
329 aa  190  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.64 
 
 
329 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.5 
 
 
329 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.64 
 
 
329 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>