More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC03050 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC03050  signal recognition particle binding protein, putative  100 
 
 		 674 aa  1379    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06627  signal sequence receptor alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03850)  34.38 
 
 		 636 aa  348  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.771052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119580  predicted protein  45.54 
 
 		 525 aa  273  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00236859  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14212  predicted protein  45.16 
 
 		 308 aa  269  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0513448  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87761  GTP binding signal recognition particle receptor  37.42 
 
 		 545 aa  266  8e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1259  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.28 
 
 		 307 aa  188  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0396  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.44 
 
 		 513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0574557 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1707  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.81 
 
 		 383 aa  185  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.17802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0048  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.92 
 
 		 383 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0893  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.18 
 
 		 383 aa  184  6e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0204  signal recognition particle-docking protein FtsY  35 
 
 		 379 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1564  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.39 
 
 		 379 aa  177  6e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0110  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.93 
 
 		 366 aa  177  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228943  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1320  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.62 
 
 		 358 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0676777  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0462  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.56 
 
 		 422 aa  174  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1509  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.89 
 
 		 400 aa  172  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00480326  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3022  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.38 
 
 		 353 aa  171  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1965  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.86 
 
 		 354 aa  166  9e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1631  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.23 
 
 		 373 aa  166  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00422743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1878  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.56 
 
 		 344 aa  163  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115823 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0543  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.72 
 
 		 409 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00293092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1475  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.69 
 
 		 337 aa  160  5e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.487639  decreased coverage  0.0000361421 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1229  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.35 
 
 		 367 aa  159  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.77749  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0239  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.25 
 
 		 529 aa  158  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1815  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.53 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0429  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.3 
 
 		 302 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0870  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.03 
 
 		 302 aa  154  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0821  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.28 
 
 		 371 aa  154  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1328  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.57 
 
 		 394 aa  143  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1605  signal recognition particle-docking protein FtsY  30.46 
 
 		 305 aa  143  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1659  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.14 
 
 		 305 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0461  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.89 
 
 		 307 aa  140  6e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1829  signal recognition particle-docking protein FtsY  29.5 
 
 		 305 aa  135  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.704875 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2089  signal recognition particle protein  28.15 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00342036  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2723  signal recognition particle-docking protein FtsY  29.2 
 
 		 488 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2950  signal recognition particle-docking protein FtsY  29.2 
 
 		 488 aa  130  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260236  hitchhiker  0.00455351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4411  signal recognition particle-docking protein FtsY  28.86 
 
 		 437 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  30 
 
 		 446 aa  130  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2845  signal recognition particle-docking protein FtsY  30.03 
 
 		 493 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.634202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  29.84 
 
 		 535 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  30.24 
 
 		 443 aa  127  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  31.05 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  29.85 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3410  signal recognition particle-docking protein FtsY  27.79 
 
 		 473 aa  125  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.457129 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  34.29 
 
 		 553 aa  124  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  34.29 
 
 		 541 aa  124  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.29 
 
 		 523 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  29.13 
 
 		 495 aa  124  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  31.61 
 
 		 452 aa  124  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  31.61 
 
 		 452 aa  124  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  33.88 
 
 		 498 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.88 
 
 		 497 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  33.88 
 
 		 498 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  33.88 
 
 		 498 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  33.88 
 
 		 498 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  28.85 
 
 		 471 aa  123  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3341  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  29.82 
 
 		 522 aa  123  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  33.88 
 
 		 498 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  33.88 
 
 		 497 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  33.88 
 
 		 512 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  33.88 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  33.88 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  33.88 
 
 		 511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  33.88 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  33.88 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  27.94 
 
 		 463 aa  122  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3091  signal recognition particle-docking protein FtsY  27.06 
 
 		 520 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.694563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0978  signal recognition particle protein  28.92 
 
 		 508 aa  122  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.304091  normal  0.442389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2887  signal recognition particle protein  29.5 
 
 		 522 aa  122  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.74 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0361  signal recognition particle-docking protein FtsY  27.59 
 
 		 408 aa  121  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  29.36 
 
 		 521 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  28.85 
 
 		 432 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  26.99 
 
 		 452 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  29.57 
 
 		 507 aa  121  4.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  28.66 
 
 		 453 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  29.69 
 
 		 447 aa  121  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0630  signal recognition particle protein  29.2 
 
 		 520 aa  120  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3683  signal recognition particle protein  29.91 
 
 		 526 aa  120  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.91 
 
 		 451 aa  120  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0662  signal recognition particle protein  29.2 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  33.47 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  26.84 
 
 		 512 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.92 
 
 		 485 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0375  signal recognition particle-docking protein FtsY  27.54 
 
 		 315 aa  120  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  33.47 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1826  signal recognition particle protein  30.12 
 
 		 523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0651  signal recognition particle protein  29.2 
 
 		 520 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0971217  normal  0.157335 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2409  signal recognition particle protein  26.87 
 
 		 454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000225745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  27.84 
 
 		 452 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3750  signal recognition particle protein  29.53 
 
 		 527 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1758  signal recognition particle protein  30.12 
 
 		 523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  27.25 
 
 		 452 aa  118  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14711  signal recognition particle protein (SRP54)  27.27 
 
 		 492 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.657856  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1382  signal recognition particle protein  27.36 
 
 		 489 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14851  signal recognition particle protein (SRP54)  27.66 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2543  signal recognition particle protein  26.63 
 
 		 528 aa  119  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.864266  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14471  signal recognition particle protein (SRP54)  28.18 
 
 		 492 aa  118  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0517  signal recognition particle-docking protein FtsY  26.87 
 
 		 315 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  27.99 
 
 		 444 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>