More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14212 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_14212  predicted protein  100 
 
 
308 aa  634    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0513448  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03050  signal recognition particle binding protein, putative  45.16 
 
 
674 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06627  signal sequence receptor alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03850)  44.51 
 
 
636 aa  252  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.771052  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119580  predicted protein  42.91 
 
 
525 aa  235  7e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00236859  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87761  GTP binding signal recognition particle receptor  42.44 
 
 
545 aa  205  7e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1564  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.76 
 
 
379 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1259  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.73 
 
 
307 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1631  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.54 
 
 
373 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00422743  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1509  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.2 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00480326  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0893  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.52 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0048  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.73 
 
 
383 aa  171  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0204  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.84 
 
 
379 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1707  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.96 
 
 
383 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.17802  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1815  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.78 
 
 
470 aa  169  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1320  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.69 
 
 
358 aa  167  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0676777  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1328  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.33 
 
 
394 aa  167  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0462  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.52 
 
 
422 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1965  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.52 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1229  signal recognition particle-docking protein FtsY  35 
 
 
367 aa  166  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.77749  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0396  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.56 
 
 
513 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0574557 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0110  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.69 
 
 
366 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0228943  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1878  signal recognition particle-docking protein FtsY  35.17 
 
 
344 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.115823 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1475  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.79 
 
 
337 aa  159  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.487639  decreased coverage  0.0000361421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0239  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.44 
 
 
529 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0429  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.23 
 
 
302 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3022  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.1 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0543  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.79 
 
 
409 aa  152  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00293092  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  33.21 
 
 
449 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.91 
 
 
329 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  39.91 
 
 
329 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.91 
 
 
329 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.91 
 
 
329 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  39.13 
 
 
491 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  31.14 
 
 
446 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  38.7 
 
 
491 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  39.13 
 
 
491 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  39.13 
 
 
491 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  40.87 
 
 
491 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.35 
 
 
497 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  38.26 
 
 
511 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.63 
 
 
447 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  39.46 
 
 
329 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  33.92 
 
 
329 aa  149  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  40.87 
 
 
498 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.33 
 
 
413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.46 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.46 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  40.87 
 
 
498 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.01 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  40.5 
 
 
469 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  40.87 
 
 
497 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0821  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.53 
 
 
371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  40.87 
 
 
512 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  40.87 
 
 
498 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  40.87 
 
 
498 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  40.87 
 
 
498 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  34.94 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.98 
 
 
329 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0870  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.79 
 
 
302 aa  147  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.83 
 
 
643 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.98 
 
 
329 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.63 
 
 
507 aa  145  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.26 
 
 
491 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  33 
 
 
373 aa  145  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.63 
 
 
326 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2496  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.7 
 
 
312 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  40.38 
 
 
497 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  34.31 
 
 
453 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.36 
 
 
492 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.92 
 
 
447 aa  143  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  32.2 
 
 
479 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1157  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.7 
 
 
508 aa  143  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000684917  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0170  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.35 
 
 
347 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.200798  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  39.2 
 
 
452 aa  142  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1829  signal recognition particle-docking protein FtsY  32.43 
 
 
305 aa  142  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.704875 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  31.76 
 
 
449 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  31.76 
 
 
449 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  31.76 
 
 
449 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  31.76 
 
 
449 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  31.76 
 
 
449 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  33.45 
 
 
445 aa  142  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.39 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.76 
 
 
377 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0673  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.38 
 
 
444 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  31.42 
 
 
449 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  39.24 
 
 
444 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.23 
 
 
485 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.36 
 
 
561 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  31.42 
 
 
449 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19561  signal recognition particle protein (SRP54)  29.62 
 
 
494 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.20972 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0707  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.13 
 
 
469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.46 
 
 
452 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0560  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.83 
 
 
506 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000445569  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  37.68 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  30.27 
 
 
512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  38.07 
 
 
446 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1825  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (SRP54)  31.42 
 
 
516 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0708  signal recognition particle-docking protein FtsY  31.38 
 
 
469 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.81 
 
 
535 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3468  cell division protein FtsY  36.36 
 
 
563 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00185267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>