61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0832 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0832  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  523  1e-147  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0391  putative transcriptional regulator, AsnC family  55.91 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494211  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0797  AsnC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1715  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.128343 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 161 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  37.7 
 
 		 162 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 157 aa  45.8  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  45.83 
 
 		 153 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  28.75 
 
 		 166 aa  45.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  45.83 
 
 		 153 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  45.83 
 
 		 153 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  45.83 
 
 		 153 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 186 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.33 
 
 		 181 aa  45.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  38.33 
 
 		 165 aa  45.4  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  33.93 
 
 		 148 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  32.06 
 
 		 143 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 154 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2237  AsnC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 168 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1377  AsnC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370813  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2719  AsnC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519485  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0428  AsnC family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 172 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.717716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 148 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  32.79 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1225  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 143 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2138  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 147 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 152 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 181 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  35 
 
 		 152 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 149 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  32.79 
 
 		 169 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 163 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 		 153 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 		 153 aa  43.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 147 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4434  transcriptional regulator, AsnC family  23.53 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.33 
 
 		 153 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  28.12 
 
 		 161 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 167 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 		 148 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 148 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 148 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  32.43 
 
 		 152 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  32.43 
 
 		 152 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  32.43 
 
 		 152 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  32.79 
 
 		 160 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 162 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 144 aa  42  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 156 aa  42  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  32.43 
 
 		 152 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.9 
 
 		 153 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 137 aa  42  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 192 aa  42  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 154 aa  42  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>