170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0392 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
105 aa  213  7e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.333878  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1270  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.38 
 
 
106 aa  104  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.246103  hitchhiker  0.0000000754638 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0729  conserved hypothetical protein  45.36 
 
 
102 aa  100  8e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.06 
 
 
285 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45 
 
 
504 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 
322 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  30.43 
 
 
270 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2796  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.83 
 
 
326 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  38.24 
 
 
359 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  35 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  32.84 
 
 
521 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.36 
 
 
372 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.79 
 
 
289 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
521 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  39.29 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  31.87 
 
 
111 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1996  nitrite reductase  34.15 
 
 
118 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0459175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2145  nitrite reductase [NAD(P)H] small subunit  34.15 
 
 
118 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  40 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1113  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.78 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.74 
 
 
513 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.07 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08691  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  42.11 
 
 
440 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.61 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.61 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.51 
 
 
353 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.62 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.42 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  32.63 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  34.38 
 
 
110 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2292  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  36.51 
 
 
105 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.51 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  33.75 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2423  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  40.98 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  35.29 
 
 
347 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2471  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  40.98 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26080  vanillate demethylase subunit A  32.22 
 
 
377 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0817  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  33.73 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  42 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  32.91 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  30.53 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1001  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.78 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.21 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2285  vanillate monooxygenase  37.1 
 
 
367 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.138524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.12 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1969  nitrite reductase (NAD(P)H)  32.93 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.595397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1948  nitrite reductase  32.93 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1482  Rieske (2Fe-2S) region  32.2 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  30.43 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45 
 
 
527 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2151  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  32.93 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.981833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4349  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.19 
 
 
516 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504096  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.67 
 
 
604 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1989  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.93 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2176  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  32.93 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.69 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.42 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2964  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  35.62 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.59 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.94 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  27.68 
 
 
355 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  41.3 
 
 
345 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0940  putative Rieske (2Fe-2S) ferredoxin  30.77 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2693  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
506 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563055  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  31.33 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.33 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.2 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3163  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  31.71 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.33632  normal  0.290875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0463  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  39.34 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  42.37 
 
 
437 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0622  putative Rieske (2Fe-2S) protein  29.36 
 
 
314 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0948094 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.93 
 
 
370 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  29.47 
 
 
111 aa  42.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.8 
 
 
337 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.67 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.82 
 
 
294 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1989  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  38.98 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1137  vanillate monooxygenase  31.25 
 
 
350 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  hitchhiker  0.000140047 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3131  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  40 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0740  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  40 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01479  dioxygenase, ferredoxin reductase component, putative  33.33 
 
 
559 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0817  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  35.19 
 
 
440 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.47807  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1359  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.59 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.41 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1267  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  32 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  38.18 
 
 
352 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2246  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00879762  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3775  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.79 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.68 
 
 
326 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.18 
 
 
352 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2106  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  36.51 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298831  normal  0.595074 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0100  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  40 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.18 
 
 
352 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2918  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  40 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  37.25 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  37.88 
 
 
361 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 
365 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>