47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2900 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  100 
 
 		 160 aa  329  8e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  43.24 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  43.15 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  39.47 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  38 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10692  hypothetical protein  35.17 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  38.3 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  34.69 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  35.34 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  32.54 
 
 		 153 aa  88.2  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  31.29 
 
 		 153 aa  87  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  33.1 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  34.29 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  31.29 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  33.58 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  33.58 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  33.58 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  32.8 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  31.08 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  30.46 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  29.53 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17010  predicted transcriptional regulator  34.43 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.491454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  29.77 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  29.17 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  29.8 
 
 		 169 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  32.19 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  27.66 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  30.94 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  31.85 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  31.54 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  26.21 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  31.72 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  31.72 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  27.52 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  25.9 
 
 		 316 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  31.54 
 
 		 241 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  35.14 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 268 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  27.15 
 
 		 239 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3210  transcriptional regulator  27.7 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1229  hypothetical protein  30.34 
 
 		 187 aa  43.9  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  25.48 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10078  hypothetical protein  31.46 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.866988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  36.51 
 
 		 183 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  30 
 
 		 186 aa  41.2  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4898  hypothetical protein  29.79 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.231509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>