97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1182 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 72 aa  142  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  58.46 
 
 		 73 aa  86.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  43.1 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2414  preprotein translocase subunit SecE  32.31 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000338556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  32.31 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  37.5 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  31.03 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  33.8 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  35.21 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  38.3 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 187 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  35.94 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  33.9 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  35.94 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  39.29 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  45.71 
 
 		 51 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1808  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  32.31 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.480842  normal  0.242423 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  29.23 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0356  preprotein translocase subunit SecE  32.76 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0381  preprotein translocase subunit SecE  32.76 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  36.73 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  36.96 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3351  preprotein translocase subunit SecE  36.92 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.558222  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  41.67 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1742  preprotein translocase, SecE subunit  35.94 
 
 		 78 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  35.38 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  41.67 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1766  preprotein translocase, SecE subunit  35.94 
 
 		 78 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000113804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002167  preprotein translocase subunit SecE  37.25 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  26.87 
 
 		 73 aa  42.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2042  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000127265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  34 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.3 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  32.65 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  35.94 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00231  preprotein translocase subunit SecE  35.29 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  27.78 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  28.3 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  31.37 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  32.61 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  32 
 
 		 80 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2427  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000113159  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.5 
 
 		 86 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  31.48 
 
 		 76 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  42 
 
 		 89 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3452  preprotein translocase, SecE subunit  36.36 
 
 		 126 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.0121626 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  41.3 
 
 		 65 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  41.3 
 
 		 65 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  35.42 
 
 		 64 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4469  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000281914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03857  translocase  33.93 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000542011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4014  preprotein translocase, SecE subunit  33.93 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000048748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4214  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.05954e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4520  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  40.43 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03810  hypothetical protein  33.93 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4044  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000141034  hitchhiker  0.00697666 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  41.51 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4429  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000053467  hitchhiker  0.0000280733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5446  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000383194  hitchhiker  0.0067856 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0565  preprotein translocase subunit SecE  34.69 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  34.69 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  36 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  30.61 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2804  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191785  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0333  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000137856  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3866  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.21747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0191  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000178123  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4553  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00306238  hitchhiker  0.000000000000770632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4389  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515047  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  37.25 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4479  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000837942  decreased coverage  0.00000000000000405738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4476  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000966143  hitchhiker  0.00190417 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0194  preprotein translocase subunit SecE  32 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062993  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2724  preprotein translocase subunit SecE  37.25 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0204  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00011223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  31.25 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  41.2  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4357  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000161707  normal  0.74438 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  32.69 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0199  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3737  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168661  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  34.78 
 
 		 63 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  43.48 
 
 		 136 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>