More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0625 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 321 aa  642    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  72.14 
 
 		 314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  60.14 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  60.5 
 
 		 309 aa  332  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  49.2 
 
 		 312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  56 
 
 		 305 aa  322  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  50.65 
 
 		 299 aa  318  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  50.16 
 
 		 300 aa  306  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  48.39 
 
 		 303 aa  301  9e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  53.02 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  53.58 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  53.41 
 
 		 315 aa  288  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  46.95 
 
 		 311 aa  285  9e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  44.05 
 
 		 306 aa  279  6e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  48.75 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  42.58 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  44.65 
 
 		 323 aa  261  8e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  44.98 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  42.12 
 
 		 319 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  45.64 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  46.9 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2080  periplasmic solute binding protein  44.41 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  35.99 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1995  periplasmic solute binding protein  39.34 
 
 		 370 aa  208  8e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  34.16 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  34.75 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  32.4 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  36.36 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  32.97 
 
 		 303 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.34 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  32.59 
 
 		 325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  36.21 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  32.06 
 
 		 298 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  35.67 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  35.34 
 
 		 301 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  32.5 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  36.3 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  34.28 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  31.66 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  33.69 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  35.35 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  35.29 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  34.02 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  35.34 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  34.14 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  31.31 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  33.01 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  34.55 
 
 		 307 aa  155  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  28.31 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  31.34 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.38 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  31.79 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  32.62 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  32.28 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  28.83 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  38.25 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  32.14 
 
 		 291 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  35.48 
 
 		 311 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  30.63 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  30.63 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  32.65 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  33.21 
 
 		 303 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  30.89 
 
 		 356 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  32.27 
 
 		 292 aa  149  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  33.69 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  32.98 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  31.21 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  32.44 
 
 		 321 aa  146  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  32.03 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  34.04 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  30.97 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  33.79 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  29.34 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  27.52 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  31.68 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  29.34 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  32.23 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  30.14 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  27.52 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  29.96 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  29.96 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  30.07 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  30.35 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  27.8 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  32.37 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  29.1 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  26.71 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  26.71 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  29.24 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  33.97 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  30.22 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2805  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 326 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0722  AfeA  29.51 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.738909  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  30.35 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>