159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6126 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  100 
 
 		 577 aa  1162    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  72.58 
 
 		 571 aa  791    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  47.03 
 
 		 583 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  36.44 
 
 		 997 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  32.38 
 
 		 570 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  32.05 
 
 		 570 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  32.8 
 
 		 559 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  34.02 
 
 		 562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  30.63 
 
 		 566 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  32.55 
 
 		 561 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  37.58 
 
 		 578 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  34.16 
 
 		 283 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  34.11 
 
 		 285 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  35.71 
 
 		 274 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  34.11 
 
 		 285 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  35.71 
 
 		 274 aa  94  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  35.14 
 
 		 285 aa  92  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  30.69 
 
 		 453 aa  91.3  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  35.71 
 
 		 274 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  33.08 
 
 		 288 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  30.23 
 
 		 284 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  31.41 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  31.3 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  28.62 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  37.92 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  29.51 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  33.46 
 
 		 279 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  33.1 
 
 		 277 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  33.07 
 
 		 278 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  32.55 
 
 		 276 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  32.84 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  31.3 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  29.32 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  29.26 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  31.56 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  28.84 
 
 		 240 aa  76.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  28.53 
 
 		 692 aa  74.3  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  32.06 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  32.06 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  31.71 
 
 		 454 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  27.04 
 
 		 250 aa  72.8  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  31.88 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  31.88 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  29.48 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  28.69 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  29.13 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  35.32 
 
 		 254 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  30.45 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  31.08 
 
 		 289 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  27.82 
 
 		 283 aa  69.7  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  31.08 
 
 		 289 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  33.09 
 
 		 243 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.58 
 
 		 243 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  32.68 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  33.85 
 
 		 710 aa  68.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  31.35 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  32.47 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  29.03 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  30.42 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  28.68 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  30.42 
 
 		 285 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  28.81 
 
 		 238 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  29.55 
 
 		 288 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  29.92 
 
 		 290 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  30.12 
 
 		 287 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  29.55 
 
 		 288 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  29.55 
 
 		 290 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  31.29 
 
 		 279 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  26.78 
 
 		 232 aa  66.2  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  29.55 
 
 		 290 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  28.62 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  27.16 
 
 		 598 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0187168  normal  0.160619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.21 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  29.67 
 
 		 674 aa  65.1  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  30.04 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  32.51 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  27.3 
 
 		 662 aa  64.3  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  28.88 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.38 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  30.26 
 
 		 294 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2044  porin  29.26 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  28.03 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  27.31 
 
 		 254 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  27.94 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0429  putative 31 kDa outer-membrane immunogenic protein precursor  30.71 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.22814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  27.94 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  28.1 
 
 		 652 aa  60.5  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  26.96 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  30.31 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  27.53 
 
 		 243 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  30.13 
 
 		 245 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  28.72 
 
 		 689 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  26.44 
 
 		 245 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  30 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  28.27 
 
 		 212 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  27.34 
 
 		 247 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7845  porin  29.89 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  26.69 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  29.81 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4376  putative outer-membrane protein  27.05 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36541  normal  0.0609964 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>